在进行养殖场拆迁时，养殖动物的补偿问题并没有明确的法律规定。一般来说，根据存栏禽畜的种类、大小和市场价格，结合双方协商确定补偿金额。
根据《畜禽规模养殖污染防治条例》第二十五条的规定，如果因畜牧业发展规划、土地利用总体规划、城乡规划调整以及划定禁养区域，或者因对污染严重的畜禽养殖密集区域进行综合整治，确需关闭或搬迁现有畜禽养殖场所，导致养殖者遭受经济损失，县级以上地方人民政府将依法进行补偿。
1. 禁养区：畜禽养殖禁养区是根据法律、法规和行政规章的规定，在指定范围内禁止任何单位和个人养殖畜禽。禁养区内已建成的畜禽养殖场（点）将按照法律要求，由各县（市、区）人民政府责令限期搬迁或关闭。
2. 限养区：畜禽养殖限养区是指禁养区和适养区之间的过渡区域，旨在保护禁养区。根据法律、法规和行政规章的规定，在一定区域内限制畜禽养殖数量，禁止新建规模化畜禽养殖场。限养区内现有的畜禽养殖场应按要求进行治理，确保污染物处理达到排放要求。如果无法在规定时间内完成治理，应当搬迁或关闭。
3. 适养区：畜禽养殖适养区是指除禁养区和限养区以外的区域，原则上可以用于畜禽养殖。在畜禽养殖适养区内从事畜禽养殖的单位和个人，应遵守国家有关建设项目环境保护管理规定，并进行环境影响评价。其污染物排放不得超过国家和地方规定的排放标准和总量控制要求。
4. 禁养区范围：
① 生活饮用水水源保护区、风景名胜区、自然保护区的核心区和缓冲区；
② 城市和城镇中的居民区、文教科研区、医疗区等人口集中地区；
③ 市人民政府和各县（市、区）人民政府根据法律规定划定的禁养区域；
④ 国家或地方法律、法规规定需要特殊保护的其他区域。
集体土地上的养殖场拆迁补偿问题，包括土地使用权补偿、厂房重置成新价、停产停业损失费、装修附属物和机器设备的补偿以及搬迁费用等。补偿需要考虑多种因素，如土地使用权性质和使用年限、厂房结构特征、合法经营主体等。
划入禁养区的养殖场拆迁款的计算方式。包括建筑物、附属设施的补偿，停产停业损失的补偿，存栏禽畜出清的补偿，搬迁补偿以及可能的奖励等。因环保或规划原因导致的养殖场关停或搬迁，县级以上地方政府应依法进行补偿。禁养区养殖场的关停或搬迁并不意味着没有补偿。
养殖场被强制拆迁后的维权方式以及禁养区养殖场拆迁的赔偿标准。针对非法强拆，被拆迁人可报案并起诉要求赔偿。拆迁补偿包括存栏畜禽补助和养殖场补偿，具体标准因地区而异，一般由县级政府制定方案。
养殖场被认定为违章建筑拆迁时的补偿问题。根据相关规定，违法建筑和超过批准期限的临时建筑在征收时不予补偿，而合法建筑和未超过批准期限的临时建筑则应得到补偿。养殖场的退出拆迁分为不同情况，包括禁养限养区内养殖场、主要河流流域限制范围内的养殖场以及手续不合
