根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条和第六十五条的规定，对于农村小产权房中的违法建筑，城乡规划部门将采取相应的处罚措施。
如果小产权房属于违法建筑，城乡规划部门有权责令其限期拆除。
对于未取得建设工程规划许可证或者未按照规定进行建设的小产权房，县级以上地方人民政府城乡规划主管部门有权责令停止建设，并限期采取改正措施消除对规划实施的影响。如果改正措施可行，需要在规定时间内进行改正，否则将面临罚款。
如果小产权房无法通过改正措施消除对规划实施的影响，城乡规划部门可以限期拆除，并可以没收实物或者违法收入。同时，还可以对该小产权房处以罚款，罚款金额不超过建设工程造价的百分之十。
在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照规定进行建设的小产权房，乡、镇人民政府有权责令停止建设，并可以在逾期不改正的情况下进行拆除。
根据小产权房的不同类型，对于过户手续有不同的规定。
对于在由单位享有使用权的国有划拨土地或出让土地上建设的住房和经济适用房，只需补交土地出让金或者购房超过5年，即可进行过户手续。
对于在集体土地上建设的小产权房，是不能够进行过户的。这是因为这类小产权房属于当地政府占用集体土地建设的房屋，不受国家法律的保护和认可。购房人没有真正的产权，无法行使房屋的各项处置权利。因此，这类房屋无法进行上市交易，也无法进行过户。
总之，只有满足上市条件的小产权房，如国有划拨土地或出让土地上建设的住房和经济适用房，才具备过户的资格。
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