1、申请司法确认调解协议的，双方当事人应当本人或者由符合民事诉讼法第五十八条规定的代理人向调解组织所在地基层人民法院或者人民法庭提出申请。
2、法律依据：《最高人民法院关于适用《中华人民共和国民事诉讼法》的解释》
第三百五十三条 申请司法确认调解协议的，双方当事人应当本人或者由符合民事诉讼法第五十八条规定的代理人向调解组织所在地基层人民法院或者人民法庭提出申请。
(一)调解的开始
法院调解无论在哪种程序和哪个阶段适用，它的开始均包括两种方式：一是由当事人提出申请而开始;二是法院在征得当事人同意后主动依职权调解而开始。审判人员在这一阶段的主要工作是，征求双方当事人是否愿意调解的意见，讲明调解的好处、要求和具体作法，并告知有关的诉讼权利和义务，用简便的方式通知当事人和证人到庭，为调解的进行做好准备。
(二)调解的进行
法院调解在审判人员的主持下进行。调解工作既可以由合议庭共同主持，也可以由合议庭中的一个审判员主持，适用简易程序审理的案件可以由独任审判员主持。根据案情的需要，调解时可以邀请有关单位和个人、当事人所在地的基层组织参加，被邀请的有关单位和个人以及当事人所在地的基层组织应当积极协助法院进行调解。这种做法有利于对当事人进行思想教育和疏导工作，顺利解决当事人之间的争议。
法院调解时，双方当事人都应出庭，原则上要采取面对面的形式进行调解。但必要时也可以分别对双方当事人做调解工作。当事人不能出庭而委托诉讼代理人参加调解的，必须有当事人的特别授权。对无诉讼行为能力的当事人进行调解，应当由其法定代理人代为参加。离婚案件当事人确因特殊情况无法出庭参加调解的，除本人不能表达意志的以外，应当出具书面意见。在一般情况下，涉及精神病人的离婚案件，除了有关子女抚养和财产分割问题可以由其法定代理人同对方协商外，对于是否解除双方的婚姻关系，应当采用判决方式确认。法定代理人与对方达成协议要求发给判决书的，可以根据调解协议的内容制作判决书。
(三)调解的结束
调解的结束包括两种情况：一是因当事人达成调解协议而结束;一是因调解不成，未达成调解协议而结束。对于经调解达成协议的，人民法院应当及时对调解协议进行审查。
司法鉴定与和解的关系。在民事案件中，对于因民间纠纷引起的违反治安管理行为，可以进行调解处理。刑事案件的和解适用于因民间纠纷引起的案件和过失犯罪案件。司法鉴定是服务于司法诉讼活动的技术性活动，对于维护法律尊严、促进司法公正有重要作用。
轻伤刑事案件在公安机关调解后的赔偿金额解决方式。双方需协商解决赔偿金额，如协商不成，公安机关会进行调解。公安机关等机关在当事人和解时会审查自愿性和合法性，并制作和解协议书。对于达成和解协议的案件，公安机关等可向司法机关提出从宽处理和从宽处罚的建议。
8月29日，昌江法院乌烈法庭迅速审结了一起涉及人民调解协议的司法确认案件。案件从立案到结案仅用了一天时间，这是该法院成立以来首次对人民调解协议做出的司法确认。案件发生
人民调解协议的法律效力为双方当事人应按约定履行协议的内容，人民调解委员会有权进行监督；如果对调解协议的履行有争议的，一方可以向法院起诉；而对于经司法确认过的调解协议，可以依法申请强制执行。
