建筑物区分所有权制度和相邻关系制度在某些方面存在交集，但也存在着明显的区别。以下是建筑物区分所有权和相邻关系的主要区别：
建筑物区分所有权是一种独立的特殊所有权制度，它由专有权、共有权和成员权相结合而成。相邻关系则不是一种独立的物权制度，其本质是对相邻不动产所有权或使用权的适当扩展或限制。
建筑物区分所有权的主体必须是该建筑物的所有权人。在现实中，只有取得建筑物的专有部分的所有权的人才能成为建筑物区分所有权人。相邻关系的主体是相互毗邻的不动产的所有人或使用人，不限于所有权人。
建筑物区分所有权的客体是建筑物的专有部分和共有部分。相邻关系的客体一般指相邻各方行使不动产所有权行为，强调的是所有人或使用人可以要求邻人提供方便，并在必要时接受限制以维护邻人的利益。
建筑物区分所有权的内容包括对专有部分、共有部分以及成员权的权利和义务。相邻关系的内容包括相邻一方有权要求相邻另一方提供必要的便利，而相邻另一方应当在必要的限度内给予方便。可以说，相邻关系是对不动产所有权的扩张，同时也对自己的权利行使施加一定限制。
建筑物区分所有权制度主要解决的是所有权的行使与保护问题，而相邻关系主要调整的是所有权的延伸和限制问题。
综上所述，当建筑物区分所有权人对建筑物的共有部分进行不当使用，妨碍了其他区分所有权人的合法权益时，其他区分所有权人可以基于对共有部分的共有权或相邻关系向不当使用共有部分的区分所有权人提出排除妨碍的请求。相比之下，基于共有部分的共有权提出的请求权被称为物上请求权。
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