在集团公司下属的多个子公司中，由于子公司具有独立法人资格和独立用人权，可以直接与员工签订劳动合同建立劳动关系。因此，当集团公司需要调动员工时，会涉及到直接用工主体的变化，因此需要对相应的劳动合同进行处理。
对于员工内部借调的情况，有两种处理方式：
1. 保留劳动关系：员工与原公司保留劳动关系，借调到新公司工作。在这种情况下，员工的工作年限可以连续计算，社会保险费仍由原公司缴纳。但是，具体工资发放和社会保险费用的承担需要通过员工借调协议来约定，员工的日常管理也取决于双方借调协议的约定。
2. 劳动合同变更：员工与原公司解除劳动合同，与新公司建立劳动关系。在这种情况下，需要终止原劳动合同，并与新公司签订新的劳动合同。是否需要支付经济补偿金取决于终止的方式以及新公司是否承继原合同的相关义务。如果新公司承认原公司的工作年限，那么工作年限可以连续计算，员工可以提出终止原合同而无需支付经济补偿金。如果新公司不愿意承继原合同的工作年限，那么终止原合同就需要支付终止补偿金。劳动合同主体变更后，原公司需要将员工的社保关系转移到新公司，由新公司按照自己的员工进行管理。
根据劳动合同法的规定，公司转让或注销时，应首先解决员工工资及经济补偿金的问题。根据您提供的信息，集团公司有意将员工转到B公司，如果B公司承认员工在A公司的工龄等相关权益，那么员工可以选择转到B公司。如果员工不愿意转到B公司，只能与A公司解除劳动合同，并由A公司支付经济补偿金。
因此，员工在这种情况下有两个选择，要么转到B公司，要么与A公司解除劳动合同。
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