可得利润损失法是一种确定计算机软件侵权直接损失的方法，它以权利人在被侵权期间可得利润的减少作为权利人的损失。这种方法的优点是所得出的损失额比较接近于实际损失，且适用范围广，可用来计算大部分软件侵权案的侵权损失额。然而，这种方法没有考虑到市场因素的影响，当市场变化较大时，不宜采用。
侵权获利法是另一种确定计算机软件侵权直接损失的方法，它以侵权者侵权所获利润作为权利人的损失。然而，在实践中，这种方法运用得比较少。主要是因为对侵权者的销售情况取证困难，不易确定侵权者的真实获得情况。此外，计算机软件属知识密集型产业，开发费用大，投资高，但复制却比较容易。一份不加的软件一经销出，就无法控制其再行复制的传播范围了。仅以查获的非法利润所得作为权利人的损失，显然是不客观的。
从社会效果来看，如果仅判定侵权者赔偿已查明的非法收益，那么对他来讲是无关痛痒的，甚至还可获得未被发现的非法收入，因此就不利于打击侵权者的违法行为。当权利人与侵权者的销售地区不在一个区域，侵权者的侵权行为对于权利人的销售情况影响不大，在不知道许可使用费的情况下，可以采用这种方法。当然，这就需要对侵权者的销售情况进行深入、细致的调查，确定查清侵权者的获利情况。
软件侵权所造成的间接损失主要为权利人行使软件作品著作权的可得利益损失。这些损失包括权利人丧失的市场份额及市场竞争力上的削弱，以及商业信誉的损失。此外，对于用制止侵权行为的合理费用也应计算在内。
在实践中，制止侵权行为的合理费用的范围一般包括：
鉴于计算机软件侵权诉讼的特点，在很多情况下，侵权行为人造成了侵权后果，给权利人造成的实际损失和侵权行为人的侵权获利由于多种原因并不易查清。当事人对此举证及人民法院查明有关事实也是十分繁杂、浩大的工程。因此，对无法查清实际损失或营利数额的，可以按一个规定的范围确定赔偿数额。
超链接与版权之间的关系。在复制权方面，超链接产生的复制行为不构成版权法意义上的复制。但在公开传播权方面，超链接存在侵权问题，需根据反不正当竞争法进行规制。为解决超链接侵权问题，可允许参考性链接等方式。文章还通过案例分析进一步说明了超链接的侵权情况。
一起出版社侵犯著作权案件。某出版社未经许可使用摄影师方-平的照片并出版发行，未署名、支付报酬，并破坏了作品的完整性。法院判决支持了原告的部分诉求，出版社被判承担侵权责任。案件涉及著作权侵权行为的构成要件，包括侵权事实、损害结果、因果联系和主观过错。
计算机软件著作权的归属问题。软件著作权的归属根据开发情况不同分为自然人、合作开发、受委托开发、国家机关任务开发、在职期间开发及法人和其他组织的软件著作权等情况，并详细阐述了各种情况下的著作权归属和行使方式。
著作权侵权诉讼时效的规定。根据最高人民法院的解释，侵犯著作权的诉讼时效为两年，但若权利人超过两年起诉且侵权行为持续，在著作权保护期内仍可追究。这一解释规定了诉讼时效的核心内容并特殊规定了对权利人的保护。但这也可能导致权利人维权意识的消极和权利的滥用。
