实质审查是发明专利申请审批程序的第二个阶段，主要是从技术角度确定发明的专利性，即审查其是否符合专利法所规定的新颖性、创造性和实用性的要求。一般来说，申请人向专利局提出实质审查请求并缴纳了审查费以后，即开始进行实质审查。但是，对国计民生有重大作用的发明，专利局认为必要的时候，可以自行对发明专利申请进行实质审查。
依据《中华人民共和国专利法》第三十五条，发明专利申请自申请日起三年内，国务院专利行政部门可以根据申请人随时提出的请求，对其申请进行实质审查；申请人无正当理由逾期不请求实质审查的，该申请即被视为撤回。国务院专利行政部门认为必要的时候，可以自行对发明专利申请进行实质审查。
根据《中华人民共和国专利法》第三十六条，发明专利的申请人请求实质审查的时候，应当提交在申请日前与其发明有关的参考资料。发明专利已经在外国提出过申请的，国务院专利行政部门可以要求申请人在指定期限内提交该国为审查其申请进行检索的资料或者审查结果的资料；无正当理由逾期不提交的，该申请即被视为撤回。
除专利法及其实施细则另有规定外，实质审查程序只有在申请人提出实质审查请求的前提下才能启动。审查员只能根据申请人依法正式呈请审查(包括提出申请时、依法提出修改时或者答复审查意见通知书时)的申请文件进行审查。
在实质审查过程中，审查员在作出驳回决定之前，应当给申请人提供至少一次针对驳回理由和证据陈述意见和/或修改申请文件的机会，即审查员作出驳回决定时，决定中涉及的驳回理由和所依据的证据应当在之前的审查意见通知书中已经告知过申请人。
在对发明专利申请进行实质审查时，审查员应当尽可能地缩短审查过程。换言之，审查员要设法尽早地结案。因此，除非确认申请根本没有被授权的前景，审查员应当在第一次审查意见通知书中，将申请中不符合专利法及其实施细则规定的所有问题通知申请人，要求其在指定期限内对所有问题给予答复，尽量地减少与申请人通信的次数，以节约程序。但是，审查员应当注意，不得以节约程序为理由而违反请求原则和听证原则。
专利申请实质审查的时限及相关流程。发明专利申请可在自申请之日起三年内提出实质审查请求，逾期则视为撤回。审查内容包括新颖性、创造性和实用性。申请人需在第一次审查意见通知书发出后的四个月内答复，后续通知书的答复时间为两个月。答复周期视通知书数量而定，通常
我国专利的申报过程，包括发明专利、实用新型专利和外观专利的申请流程以及需要提交的文件。发明专利和实用新型专利的申请流程包括专利申请、受理、初审、公告或公布、实质审查请求、实质审查和授权。外观专利的申请流程包括专利申请、受理、初步审查和授权。不同类型的
如何申请个人发明专利的流程。申请人需提交交底书并等待代理机构撰写申请文件，递交申请文件后，专利局会进行形式审查和实质审查，并与申请人沟通发明的实质内容。审查通过后，专利局授权并发出专利证书，完成专利申请流程。
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