根据商标法第十条、第十一条和第十二条规定，商标注册不当的情况包括：
1. 违反商标法第十条规定的商标禁止使用的标志。
2. 违反商标法第十一条规定的三类标志不得作为商标注册。
3. 违反商标法第十二条规定的以三维标志申请注册商标的情况。
此外，商标注册不当还包括以欺骗手段或其他不正当手段取得注册的情况。
根据商标法规定，对已注册商标的不当情况有以下处理方式：
1. 商标局撤销注册商标：
商标局有权撤销违反商标法规定的注册商标，无论何时发现，都可以予以撤销。
2. 商标评审委员会裁定撤销注册商标：
除商标局外，其他单位或个人也可以请求商标评审委员会裁定撤销违反商标法规定的注册商标。
对于恶意注册驰名商标的情况，驰名商标所有人不受五年时间限制，可以无限期追究。
对于已注册商标存在争议的情况，可以采取以下处理方式：
在商标经核准注册之日起五年内，任何单位或个人可以向商标评审委员会申请裁定。
商标评审委员会是负责处理商标争议裁定的机构，其裁定程序如下：
1. 商标评审委员会受理申请：
商标评审委员会收到裁定申请后，进行审查，符合受理条件的申请予以受理。
2. 通知有关当事人：
商标评审委员会以书面形式通知相关当事人，并限期提出答辩。
3. 答辩：
答辩是裁定程序中的必要环节，有关当事人必须在规定时间内提出答辩。商标评审委员会保障双方平等行使权利，即使有关当事人未按期提出答辩或拒绝答辩，裁定仍然进行。
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