实质审查，又称为完全审查制度，是源于1836年的美国。随着科学技术的进步，发明创造的数量不断增加，登记制度使得没有科学技术价值的申请也能获得专利权。这引起了许多专利使用者的不满，因此公众要求对发明内容进行实质审查，即除了形式审查外，还要进行新颖性、创造性和实用性的实质审查，然后才能决定是否授予专利权。
根据《中华人民共和国专利法》第三十五条规定，发明专利申请自申请日起三年内，国务院专利行政部门可以根据申请人随时提出的请求，对其申请进行实质审查。如果申请人没有正当理由逾期不请求实质审查，该申请将被视为撤回。国务院专利行政部门认为必要时，也可以自行对发明专利申请进行实质审查。
专利局在收到申请人提交的实质审查请求书、已有技术参考资料和实质审查费后，对该专利申请进行实质审查。通常要检索与发明主题有关的现有技术，并对以下问题进行审查：
审查发明是否满足专利法对发明的定义。
审查发明是否与国家法律、社会道德和公共利益相冲突。
审查发明是否属于不应被授予专利权的领域。
审查发明是否具备新颖性、创造性和实用性。
审查发明是否符合同样的发明创造只能被授予一项专利的规定。
根据专利法第九条的规定，审查发明是否属于最先申请人。
审查说明书是否清楚完整地叙述了发明的内容，并且是否符合规定。
审查权利要求书是否以说明书为依据，是否明确了要求保护的范围，并且是否符合规定。
审查专利申请是否符合单一性的要求。
审查申请人对申请文件的修改或分案是否明显超出了原说明书和权利要求书所记载的范围。
经过实质审查，如果专利局认为申请不符合上述专利法规定，将以书面形式通知申请人，并要求在指定的期限内进行修改或陈述意见。如果申请人没有正当理由在期限内答复，申请将被视为撤回。如果申请人补正或陈述意见后，专利局仍然认为申请不符合上述规定，将予以驳回并通知申请人。如果申请人不服驳回决定，可以向专利复审委员会请求复审。
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