划入生态保护区后，房屋如果有合法证件的，是属于合法的建筑，对房屋进行拆迁时，要对被拆迁人给予经济补偿。
《中华人民共和国城乡规划法》
第四十一条 在乡、村庄规划区内进行乡镇企业、乡村公共设施和公益事业建设的，建设单位或者个人应当向乡、镇人民政府提出申请，由乡、镇人民政府报城市、县人民政府城乡规划主管部门核发乡村建设规划许可证。
在乡、村庄规划区内使用原有宅基地进行农村村民住宅建设的规划管理办法，由省、自治区、直辖市制定。
在乡、村庄规划区内进行乡镇企业、乡村公共设施和公益事业建设以及农村村民住宅建设，不得占用农用地;确需占用农用地的，应当依照《中华人民共和国土地管理法》有关规定办理农用地转用审批手续后，由城市、县人民政府城乡规划主管部门核发乡村建设规划许可证。
建设单位或者个人在取得乡村建设规划许可证后，方可办理用地审批手续。
第六十四条 未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设;尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款;无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。
第六十五条 在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正;逾期不改正的，可以拆除。
中国国有土地上房屋征收与补偿条例中关于违建房强拆的问题。对违法建筑进行强制拆除时，没有拆迁补偿。但对于合法建筑且未超过批准期限的临时建筑，应给予补偿。市、县级政府需依法对建设活动进行监管，对违法建筑进行处理。
一起因道路改造强制拆迁房屋引发的行政赔偿案件。原告陈忠江的门市房被新民市政府以“违章建筑”的名义强制拆除，但政府未出示相应的“违建”确认书，且未遵循法定程序，因此强拆行为被判定违法。虽然陈忠江获得了拆迁补偿，但他认为补偿不合理，其赔偿请求被法院驳回。
农村违建房拆迁补偿标准的相关内容。补偿标准根据房屋建设时间、地点和产权情况等因素而异。违建房屋的补偿根据建设时间确定，可能是全额补偿或部分补偿。合法建筑则根据产权证情况进行赔偿，包括登记在拆迁户主名下的房屋、只有购房合同的房屋、原房主名下的房屋等情况
无证房屋拆迁补偿的法律规定。历史遗留的无证房屋可以获得全额补偿，考虑建造时间、立法状况等因素。严重违建或恶意抢建的房屋可能不予补偿，但土地使用权应得到公平补偿。每个地方的拆迁补偿标准不同，补偿方式包括货币补偿和房屋产权调换。同时，房屋拆迁补偿包括房屋
