合作协议是否有效要根据实际情况而定
现实生活中，当亲朋戚友等熟人之间决定在共同设立公司前，准备签订合作协议的，各股东(当事人)完全可以自己协商制定协议内容，这是无可非议，合情合理的事情。况且在法律上，是没有必须由谁制定设立公司合作协议的规定，股东可以选择自己写，可以选择由他人代写，或者由专业律师代写，究竟由谁书写合作协议，完全看股东的意思。
但股东间自行书写的合作协议，是否有效要根据实际情况而定，一般存在以下两种情况：
1、通常情况下，股东在设立公司前，自愿自主签订的合作协议，只要不违法、不损害他人或社会利益，就那么协议都是有效的。各股东都需严格遵守协议约定，认真积极履行协议，否则需要承担相应的违约责任，赔偿其他股东的损失。
2、股东间签订的合作协议，实质是合同的一种。因此，根据合同法规定，各股东签订合作协议存在以下情形之一的，协议无效。
(1)一方股东以欺诈、胁迫的手段订立合作协议，损害国家利益。
(2)各股东恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益。
(3)合作协议是以合法形式掩盖非法目的。
(4)合作协议损害社会公共利益的。
(5)违反法律、行政法规的强制性规定。
《中华人民共和国公司法》第七十一条
有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。
股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权;不购买的，视为同意转让。
经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例;协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。
股东知情权的内容、理论依据以及我国法律规定存在的问题。股东知情权包括查阅权、质询权、公司检查人选任请求权和诉讼救济请求权等。我国公司法对股东知情权的规定过于简单笼统，缺乏完整逻辑体系，存在对股东质询权不明确和外部检查人选任权缺失等问题。
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公司法对股份转让的各种限制。其中包括发起人、董事、监事、高级管理人员、国家股的转让限制以及股东名册变更登记的限制等。另外，离职人员的股份转让和国有企业股票交易也受到了相应的限制。受让人和抵押权的限制也需遵循法律和行政法规的规定。
股东出资不到位需要承担的责任。股东如未按规定缴纳全部出资，需承担民事责任、行政责任和刑事责任。在民事责任方面，需补充缴足未到位的出资额并支付违约金，且在公司对外负债时需承担连带清偿责任；行政责任方面可能会面临工商行政管理部门的行政处罚；若存在虚假申报
