根据上述分类，司法实践中，关于股东会决议的效力产生的争议主要包括三类：股东会决议是否成立、股东会决议是否无效、股东会决议是否可撤销。
从形式方面来说，不可以替代。到工商局办理股权转让变更登记手续时，股权转让协议与股东会决议是两种不同的文件形式要求。
从实质方面来说，如果股东会决议的内容已经包含了股权转让的比例、价格等股权转让协议通常具有的内容时，且股东会决议上有转让方与受让方签字或盖章，则股东会决议可以代替股权转让协议。
参照民法和合同法的相关理论，总结我国司法实践中认定公司股东会决议效力的判例，公司股东会决议的效力分为如下种类：
(1)按照是否形成合意(即区分股东会决议是否成立)，分为成立和不成立两类;
(2)成立的股东会决议按照是否生效，区分为有效和无效两类;
(3)有效的股东会决议按照其效力是否存在瑕疵，分为可撤销的股东会决议和不可撤销的股东会决议。即股东会决议的效力实际有四种情况：不成立、成立但无效、成立但可撤销、成立且有效。
1.股权转让协议何时生效?
股权转让合同自成立时生效，对股权转让的双方发生法律效力。
2.股权转让的价格一定要与相应的出资额相一致吗?
不一定。股权转让价格确定的原则是在不损害国家和第三人及公司和其它股东的合法权益的条件下，由转让双方协商确定。与相应的出资额相一致是确定转让价格的参考方法之一。
3.没有约定股权转让价格的股权转让协议是否有效?
转让价格是股权转让协议的实质性条款，没有约定股权转让价格的协议因缺乏主要条款而无效。但双方协商补充条款的或特别约定的比如：赠与等，则该协议仍然有效。
4.实际投资者能否以自己的名义与受让方签署股权转让协议?
可以，但这种转让协议不能直接对公司发生效力，必须要有公司的注册股东配合签定相应的股权转让协议。如遇争议，则首先要确立实际投资人的股东地位后才能使股权转让协议有效。
5.股东会通过同意股权转让的协议但事后原股东反悔不签署股权转让协议怎么办?
视为股权转让协议没有成立。但如果造成拟股权受让方实际损失的，可追究反悔方缔约过失责任。
6.一个有限公司的48个股东与受让方签署了一份股权转让合同，也全部接受了股权转让的价款，但尚未办理工商变更登记，现在部分股东反悔，提出该合同无效可以吗?仍然同意股权转让的股东的股权转让合同有效吗?
合同自成立时生效，股权转让协议并不以工商变更登记为生效要件，因此，经合法程序签署的股权转让合同已经生效，股东的反悔并不构成其无效，仍同意股权转让的股东的转让合同当然有效。
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