医患双方可以自主自愿地进行协商处理，所达成的协议只要不是受胁迫所签或存在重大误解，其协议是合法有效的。这种处理方式对医患双方来说无疑都是最优选择，不仅利于改善医患关系，而且医院的声誉也不会受到太大影响。
根据医疗事故处理条例的规定，卫生行政管理部门可以依法对医患纠纷进行调解。
医疗事故引发的医患纠纷与非医疗事故引发的医患纠纷的法律适用是不尽相同的，前者需适用医疗事故条例进行裁决，而后者则依照《民法典》及相关司法解释予以裁判。
医疗纠纷的新的特点包括：
医疗投诉、医疗技术鉴定要求以及伤残鉴定要求逐年增多，同时新闻媒体参与的也增多。
新的《医疗事故处理条例》所采用的“举证责任倒置”，使医院出现举证不能的情况增多。
多数医疗事故与医疗纠纷发生原因复杂，相关法律法规尚不健全，而且社会各界一般认为患者是弱势群体应当加以特殊保护，因此处理起来非常困难。
特别是有些医疗事故与医疗纠纷因患者要求高额赔偿不能满足，而反复向卫生行政部门、司法部门及相关媒体投诉，加之有些媒体缺乏医学知识，不明事实真相，盲目炒作，给医院的声誉造成极大损坏。
医疗事故的主体是合法的医疗机构及其医务人员，在诊疗护理中存在主观过失。根据对患者人身造成的损害程度，医疗事故分为四级：
一级医疗事故、二级医疗事故、三级医疗事故、四级医疗事故。
在日常工作中，医疗机构应当坚持“预防为主”的原则，切实采取有效措施防止医疗事故的发生。
医疗机构内死亡尸体存放时间的规定。患者死亡后，尸体应立即移至太平间存放，存放时间不得超过两周。未经医疗机构允许，严禁将尸体放置在太平间以外的地方。尸体处理需遵循一定程序，涉及尸检、家属处理等方面。医疗机构有责任暂时存放尸体，但太平间不是长期存放地。
乡镇卫生院处理医疗纠纷的程序及赔偿标准。首先建议进行调解，包括医患沟通和第三方调解。如调解不成功，则进行司法鉴定，根据结果走法律程序。法律诉讼流程包括向医疗机构投诉、申请处理、医疗事故鉴定等步骤。赔偿标准包括医疗费、误工费、住院伙食补助费和陪护费。
国务院制定的行政法规《条例》与《民法通则》在处理医疗纠纷中的关系。其中，《条例》主要从行政管理的角度规定医疗事故的技术鉴定程序、赔偿范围和标准等。而法院处理医疗纠纷案件时，主要依据的是《民法通则》，它涵盖医疗损害赔偿，遵循有损害即有赔偿的原则。此外，
医疗纠纷的解决途径，包括医患双方协商调解、申请卫生行政部门处理和向法院提起诉讼等方式。协商调解具有成本低廉、效率较高的优势，但前提是双方遵守法律规定。如协商不成，可向卫生行政部门提出处理请求，调查后给出处理意见，再次协商调解或建议患者或家属进行鉴定。
