根据合并报表原则，总公司将其净资产（亏损额）与总公司账面的拨款相抵，确认亏损。
同时，总公司应将应承接的债权和债务一并并入总公司账内。
在确认亏损时，涉及总、分公司的所得税问题，应与税务部门多次沟通联系，特别是与总公司税务部门。
如果分公司出现亏损，该亏损在最终结账时也要转到总公司。
根据《公司法》第一百八十八条，公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，并将其报送给股东会、股东大会或人民法院进行确认，然后申请注销公司登记，并公告公司终止。
我公司因经营决策问题和自已管理能力方面等原因，决定停止企业经营，故申请注销营业登记。现根据《中华人民共和国公司法》和《中华人民共和国公司登记管理条例》等有关规定，申请分公司注销登记，请予核准。 债权债务已清算完毕，如有遗留问题，一切均有总公司承
申请注销前公司应开展公司清算，公司清算完成后便可进入公司注销申请程序，清算后、注销前公司需要出具和准备如下报告：。有限责任公司提交股东会决议，股份有限公司提交股东大会决议。国有独资有限责任公司提交出资人或出资人授权部门的文件。
总公司按合并报表的方式，以其净资产（亏损额）与总公司账面的拨款相抵并确认亏损。同时应将应承接的债权、债务一并并入总公司账内。在确认亏损时，涉及总、分公司的所得税问题，应多与税务联系。如果分公司是亏损的，在最后结账时亏损也是要转到总公司的。公司清算结束
具体的处理方法是，清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，拟定提出清算方案，报股东会讨论通过或者主管机关确认，确认通过之后进行账务清理。有限责任公司的清算组由股东组成，股份有限公司的清算组由董事或者股东大会确定的人员组成。人民法院应当受理该
