合作开发的计算机软件著作权可以由各著作权人协商确定一名代表进行办理。当合作开发的软件进行著作权登记时，各著作权人可以协商确定一名代表进行办理。如果各著作权人无法达成一致，每个著作权人都有权在不损害其他著作权人利益的前提下申请登记，但需要在登记时列出其他著作权人。申请软件著作权登记时，申请者需要向软件登记中心提交软件著作权登记申请表、该软件的鉴别材料以及相关的证明文件各一式两份。
多人可以共同申请软件著作权。个人软件著作权登记是指自然人对自己独立开发完成的非职务软件作品，通过向登记机关进行登记备案的方式进行权益记录和保护的行为。
软件著作权受到一定的限制，以平衡著作权人的个人利益和社会整体利益。对软件著作权的限制主要包括以下方面：
软件开发者的身份权保护期没有限制。软件著作权的其他权利保护期为25年，截止于软件首次发表后的第25年12月31日。在保护期满之前，软件著作权人可以向软件登记机构申请续展25年，但保护期最长不超过50年。如果著作权人主体发生合法变更，如继承或单位分立、合并等法律行为，不会改变相应软件著作权的保护期。在软件著作权的保护期内，通过签订使用权或使用权许可合同转让相关权利，转让活动的发生不会改变软件著作权的保护期。当拥有软件著作权的单位终止或拥有软件著作权的公民死亡且无合法继承者时，除开发者身份权外，软件的其他权利在保护期满之前进入公有领域。
在软件著作权的保护期内，出于课堂教学、科学研究、国家机构执行公务等非商业性目的的需要，可以对软件进行少量复制，无需著作权人同意，也无需支付报酬。
软件著作权人不得损害公众利益，也不得违反其他法律。
在不经软件著作权人同意的情况下，软件复制品的合法持有人可以根据使用的需要将软件装入计算机内，制作备份复制品，并进行必要的修改等操作。
多人申请软件著作权的流程与个人申请基本相同。软件著作权受到时间限制，其中身份权不受保护期限的限制，但财产权的保护期为25年，从软件发表之日开始计算。软件著作权人依法享有著作权，但不能损害公共利益，也不能违反法律规定。
中国计算机软件著作权登记制度的重要性。软件著作权登记虽非权利产生的必要条件，但具有多重意义，包括宣传产品、强化权利主张、促进版权贸易、合法经营和销售软件、证明自主知识产权、助力软件企业认证，并享受政策鼓励。登记有助于提升软件知名度和保护著作权，对软件
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软件著作权登记的目的和作用，以及进行软件著作权登记所需的申请文件和流程。软件著作权登记旨在促进软件产业的发展和提升信息产业的创新竞争力。申请文件包括申请表、申请者身份证明、源程序和文档等。此外，还可以选择对鉴别材料作例外交存的方式。
