交易双方提出转让、受让申请，同时提交以下资料：转让协议、土地使用证、宗地界址点图、建筑物产权证明、法人资格证明、委托书、身份证明等。
市、县国土资源管理部门受理申请后，对申请人提交的材料进行审查，并征询规划管理部门对申请地块的土地用途等意见。如果申请地块用途符合规划，并且符合协议出让手续条件，管理部门将组织地价评估，确定应缴纳的土地出让金额，并拟订协议出让方案。
市、县国土资源管理部门组织对申请转让地块的出让土地使用权市场价格和划拨土地使用权权益价格进行评估，评估基准期日为拟出让时点。
管理部门根据土地估价结果、产业政策和土地市场情况等，综合决策确定应缴纳的土地使用权出让金额，并拟订协议出让方案。出让金额的核定公式如下：
(1)转让后不改变用途等土地使用条件的情况下：应缴纳的土地出让金=拟出让时的出让土地使用权市场价格-拟出让时的划拨土地使用权权益价格
(2)转让后改变用途等土地使用条件的情况下：应缴纳的土地出让金=拟出让时的新土地使用条件下出让土地使用权市场价格-拟出让时的原土地使用条件下划拨土地使用权权益价格
管理部门将协议出让方案报市、县人民政府审批。方案批准后，管理部门向申请人发出《划拨土地使用权准予转让通知书》，通知书内容包括：准予转让的标的、原土地使用权人、转让确定受让人的要求、受让人的权利、义务、应缴纳的土地出让金等。
获得《划拨土地使用权准予转让通知书》的申请人，应在土地有形市场等场所公开交易拟转让的土地使用权，确定受让人和成交价款。
经公开交易确定受让方和成交价款后，转让人与受让人签订转让合同，约定双方的权利和义务，明确划拨土地使用权转让价款。
受让人在达成交易后10日内，向市、县国土资源管理部门申请办理出让手续，提交转让合同、原土地使用证、准予转让通知书、转让方和受让方的身份证明材料等。管理部门根据批准的协议出让方案、公开交易情况等，依法收回原土地使用权人的划拨决定书，注销土地登记，收回原土地证书，并与受让方签订出让合同。
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