在医疗事故纠纷中，首先可以由医患双方自行协商达成协议，无需第三方参与。然而，这种协商方法简单明了，但容易导致矛盾的激化，特别是当双方缺乏法律知识，协议书存在漏洞时，往往会在达成协议后再次发生争端。
其次，可以由卫生行政部门主持达成调解协议。当事人一方或双方可以向卫生行政机关提出申请，在其主持下达成协议。从目前情况看，这种方法能够及时平息事态，稳定双方的情绪。
如果争议进入诉讼程序，可以由人民法院主持双方调解达成协议。该协议一经送达立即生效，具有强制执行力，不得上诉。这种方法的好处是法律效力高，具有较强的规范性。然而，医患双方需要经历较长的时间。
除了上述三种法律规定的协商解决争议方式外，还有两种新型方式可以尝试，即人民调解委员会的调解和律师参与或见证下的调解。
首先，人民调解委员会的调解是指双方当事人共同向调解委员会申请调解，由后者主持调解达成协议。这种调解程序规范，达成的协议如果没有法定撤销事由，就成为合法协议，并且不收取任何费用。然而，目前调解委员会对调解医疗纠纷争议缺乏经验，需要大胆实践。
根据《人民调解委员会组织条例》，人民调解委员会是调解民间纠纷的群众性组织，可以根据当事人的申请调解，也可以主动介入调解。根据最高人民法院的司法解释，人民调解委员会达成的协议具有合同的性质，双方当事人不得随意变更和解除，只要协议符合合同的订立原则，就是有效的，人民法院将予以确认。人民调解协议的有效条件包括：(1)当事人具备完全民事行为能力。(2)意思表示真实。(3)不违反法律、法规及社会公共利益。
其次，可以采取律师参与或见证的方式达成医疗纠纷协议。在一方或双方的律师参与的情况下，双方可以协商达成协议。这种方法的好处是可以制作较为规范的协议书，但缺点是律师见证行为不能使协议书具有很强的效力。
无论采取哪种协商解决的方法，签订合法有效的协议是必不可少的。纠纷协议实际上是一种合同行为，只要双方当事人的约定不违反我国强制法的规定和公序良俗，所达成的协议就是有效的。
首先，应严格遵守我国《合同法》的一般原则。建议在签订过程中经过公证程序。
其次，应确保“意思表示真实”。这意味着医患双方应实事求是地对医疗行为进行认定，可以先在协议书上各自列明观点，然后再写明双方一致认同的事实。
此外，由于纠纷争议发生后，双方往往处于对峙状态。有些医院可能会认为达成的协议是受到患方的胁迫。然而，根据我国《民法》规定，只有在自己或自己的近亲属受到胁迫时，才属于胁迫。许多协议还规定“患者不得就此事以任何理由起诉”，这是违反法律规定的做法。因为当事人的起诉权是民事法规定的权利。因此，协议的内容不能违反法律规定和公共利益，否则将导致纠纷协议无效。如果协议签订后，医方担心患方再次起诉，可以约定“医患双方放弃基于该债权债务关系的一切诉讼权”，或约定“因该医疗纠纷引起的一切债权债务关系就此终了”。
赔偿数额的确定是协议的重要内容。根据《条例》规定的赔偿项目及计算方法，可以作为协商确定赔偿问题的“尺度”。如果医患双方明确了纠纷争议构成侵权或医疗事故的，最好约定为“赔偿”，没有认定的则可用“补偿”的字眼。最后，由于纠纷事实构成协议的主要条款，缺少将导致合同无法实现。因此，对纠纷事实的认定最好不要省略，包括对纠纷原因、性质的认定，都应详细地写入协议中。
医疗纠纷的处理途径，包括医患协商调解、向卫生行政部门申请处理和向法院提起诉讼等。在处理过程中，医疗鉴定是重要的一环，其流程包括向市医疗鉴定委员会提起申请、受理和交费、提交陈述书等材料、选取专家鉴定组、患医陈述和专家讨论以及出具医鉴结论报告等步骤。处理
医疗事故的赔偿争议行政调解程序。在医疗事故涉及民事部分时，卫生行政部门应在双方当事人请求下进行调解，遵循自愿原则并依据规定计算赔偿数额。调解过程中涉及手术风险告知书的效力、申请行政调解的条件和程序以及重大医疗事故的上级调解程序。如果调解不成功或一方反
医疗事故后的不同调解方式。首先，自行调解可通过协商达成一致意见并签订书面协议；其次，卫生行政部门调解可依据法律规定计算赔偿金并达成协议；最后，法院调解具有法律效力和规范性，但程序相对复杂且时间较长。
法院不受理的四种医疗纠纷，包括超过时效的医疗事故争议、同时向卫生行政部门和法院提起诉讼的情况、非法行医造成刑事责任的医疗纠纷以及重要资料不全且情节不清的医疗纠纷。同时，文章还介绍了处理医疗事故纠纷的三种方式：协商解决、行政调解和司法诉讼。
