在公司清算注销后，如果发现还有未收回款项，应按照以下方式进行处理：
如果在公司注销后，发现公司有遗漏财产且尚在诉讼时效内，且各债权人的债权未能得到满足，该财产应首先按比例分配给公司的债权人。
如果各债权人的债权已经得到满足，那么该财产应归属于股东所有，并按照协议约定的比例分配给各个股东。
如果已超过诉讼时效三年，那么该财产应归属于公司，即由原股东按照出资比例获得财产分配。
如果该公司已消亡且股东也已下落不明，无人主张该项权利的，公司遗漏的财产应当收归国家所有。
对于仅仅发现财产线索尚未取回的情况，只要无人主张权利，法院也无需按照权利进行追索。
根据《中华人民共和国公司法》的相关规定：
在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，清算组应制定清算方案，并报股东会、股东大会或人民法院确认。
在支付清算费用、职工工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务后的剩余财产，有限责任公司应按照股东的出资比例分配，股份有限公司则按照股东持有的股份比例分配。
在清算期间，公司仍存在，但不得开展与清算无关的经营活动。在未清偿前，公司财产不得分配给股东。
如果清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后发现公司财产不足以清偿债务，应依法向人民法院申请宣告破产。
一旦公司经人民法院裁定宣告破产，清算组应将清算事务移交给人民法院。
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