1、对达成和解协议的案件，人民法院对被告人可以作出以下处理：
(一)人民法院应当对被告人从轻处罚;
(二)符合非监禁刑适用条件的，应当适用非监禁刑;
(三)判处法定最低刑仍然过重的，可以减轻处罚;
(四)综合全案认为犯罪情节轻微不需要判处刑罚的，可以免予刑事处罚。
2、法律依据：《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》 第五百九十六条
对达成和解协议的案件，人民法院应当对被告人从轻处罚;符合非监禁刑适用条件的，应当适用非监禁刑;判处法定最低刑仍然过重的，可以减轻处罚;综合全案认为犯罪情节轻微不需要判处刑罚的，可以免予刑事处罚。
共同犯罪案件，部分被告人与被害人达成和解协议的，可以依法对该部分被告人从宽处罚，但应当注意全案的量刑平衡。
如果是自诉案件，即是指不经过公安机关或者检察机关，由被害人或其法定代理人，向法院提起诉讼，由法院直接受理的，轻微的刑事案件。和解后原告撤回起诉，案件没有经过法院实体审判，不会被判刑，也就不会留有案底。
如果是公诉案件，对于达成和解协议的案件，公安机关可以向人民检察院，提出从宽处理的建议;人民检察院可以向人民法院，提出从宽处罚的建议。所以，刑事和解后也是需要判刑的，这样会留有案底。
而对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚，达成和解协议的案件，检察院可以作出不起诉的决定。那就不用经过法院的审判，自然也就不会被判刑，不会留有案底。
刑事和解和刑事调解在刑事自诉案件中的差异。刑事和解主要涉及被害人与犯罪嫌疑人、被告人的直接沟通协商，达成民事赔偿和解协议，并由司法机关根据案情决定刑事责任。而刑事调解则是在法院主持下，双方达成调解协议并制作调解书。刑事和解侧重经济赔偿与刑事责任处置，
刑事和解的定义、适用条件以及程序。刑事和解适用于涉及人身权利侵害或财物损毁的刑事案件，在此过程中犯罪嫌疑人需真诚悔罪并通过赔偿损失等方式获得被害人谅解。适用刑事和解的案件主要包括民间纠纷引起的犯罪案件和过失犯罪案件。达成和解协议后，国家专门机关将进行
刑事和解制度，一种恢复性司法的实践。该制度起源于加拿大并传入美国和欧洲，显示其强大的生命力。在中国，刑事和解制度的出现具有现实基础，并体现了中国特色社会主义的本质属性。刑事和解制度实质上是一种契约，旨在实现被害人损害的恢复和公共利益的保护。其优势在于
刑事和解制度在现实中的实践应用与其初衷存在的差距问题。尽管刑事和解制度旨在矫正犯罪、抚慰被害人、化解社会矛盾等，但在故意伤害案件中，能够达成刑事和解的案件极少，与制度初衷相悖。同时，刑事和解制度在实践中面临诸多困境，如制度本身不完善、赔偿金额争议、一
