根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条的规定，贷款合同的违约金计算方式应当由当事人自行协商确定。双方可以参照中国人民银行同期同类人民币贷款基准利率，并参考逾期罚息利率标准进行计算。
根据双方的约定，一方在违约时应向对方支付一定数额的违约金。
双方也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
如果约定的违约金低于实际造成的损失，当事人可以向人民法院或仲裁机构请求增加违约金；如果约定的违约金过高，当事人可以向人民法院或仲裁机构请求适当减少违约金。
当事人迟延履行约定违约金时，违约方在支付违约金后还应履行债务。
根据《中华人民共和国民法典》和相关法律法规的规定，贷款合同还包含以下规定：
借款人应按照约定的日期和数额支付利息。
借款人应按照约定的借款用途使用借款，如未按约定使用，贷款人有权停止发放借款、提前收回借款或解除合同。
总之，贷款合同的违约金计算方式应由当事人在合同中提前约定，并参考相关法律法规的规定。合同中的约定对出借方和借款方都具有约束力。
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