专利使用费的确定取决于许多因素，其中主要包括：
(1)专利权人研究开发专利所支出的费用;
(2)被许可人使用专利所能获得的经济收益;
(3)专利许可的类型、实施的行为种类和期限;
(4)被许可人支付使用费的方式和时间。
专利权使用费是如利用他人拥有的专利权而支付的使用费。专利权是国家根据发明单位或个人的申请，给予发明创造者在一定期限内对其发明创造有独占制造、使用和销售的权利。它属一种知识产权，同其他产权一样，是排他性的，即在专利权的有效期限内，非经专利权人同意，其他人不得用以制造、使用和销售其专利产品。
专利权的确定根据不同的情形，按照下列方式办理：
(一)执行本单位的任务或者主要是利用本单位的物质技术条件所完成的发明创造为职务发明创造。职务发明创造申请专利的权利属于该单位;申请被批准后，该单位为专利权人。
(二)利用本单位的物质技术条件所完成的发明创造，单位与发明人或者设计人订有合同，对申请专利的权利和专利权的归属作出约定的，从其约定。
(三)非职务发明创造，申请专利的权利属于发明人或者设计人;申请被批准后，该发明人或者设计人为专利权人。
(四)两个以上单位或者个人合作完成的发明创造，除另有协议的以外，申请专利的权利属于共同完成的单位或者个人;申请被批准后，申请的单位或者个人为专利权人。
(五)一个单位或者个人接受其他单位或者个人委托所完成的发明创造，除另有协议的以外，申请专利的权利属于完成的单位或者个人;申请被批准后，申请的单位或者个人为专利权人。
(六)两个以上的申请人分别就同样的发明创造申请专利的，专利权授予最先申请的人。
专利使用费属于特许权使用费，专利权的归属问题，要根据专利的申请情况来确定，执行单位的任务而完成的专利，专利权归单位所有，利用单位的物质条件完成的发明专利，专利权需要由单位和发明人协商来确定，非职务发明创造的专利，发明人是专利权人。
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