根据人民法院组织法的规定，我国设立了军事法院等专门人民法院。目前已建立的受理刑事案件的专门人民法院有军事法院、铁路运输法院。
根据刑事诉讼法第27条的规定，专门人民法院案件的管辖另行规定。在司法实践中，军事法院主要管辖现役军人和军内在编职工违反刑法分则第十章，犯军人违反职责罪的犯罪案件。
铁路运输法院主要管辖铁路运输系统公安机关负责侦破的刑事案件。这些案件包括危害和破坏铁路交通和安全设施的犯罪案件，以及在火车上发生的犯罪案件，铁路职工违反规章制度、玩忽职守造成严重后果的犯罪案件等。
在司法实践中，涉及军队和地方互涉案件的管辖权争议问题，应该依据相关的司法解释，根据不同情况进行处理：
公安机关、检察院和法院在刑事案件受理方面的职能管辖以及审判管辖。公安机关负责侦查工作，检察院负责立案侦查国家工作人员利用职权实施的犯罪行为，人民法院则直接受理自诉的刑事案件。审判管辖方面，根据级别、地域和专门性进行分类，不同级别法院管辖不同性质的刑事
移送管辖的概念及其在法院间案件的转移中的应用。移送管辖发生在受理案件后发现无管辖权时，将案件移送给有管辖权的另一法院，以确保案件得到正常审理。其范围通常发生在同级法院间，也可能发生在上下级法院间。同时，根据民事诉讼法、行政处罚法和刑事诉讼法的规定，对
刑事案件立案级别管辖的相关规定。其中，不同类别的刑事案件由不同机关管辖，如公安机关、军队内部公安机关、监狱内公安机关等。犯罪地和居住地的管辖原则以及交通工具上发生的刑事案件的管辖也有所涉及。对于几个公安机关都有权管辖的刑事案件，一般按照最初受理或主要
自诉案件的类型和管辖。自诉案件包括告诉才处理的案件、人民检察院未提起公诉的轻微刑事案件以及被害人有证据证明应当追究刑事责任的案件。法院对自诉案件的管辖不仅限于基层法院，中级和高级人民法院也会管辖部分特殊和严重的案件。管辖原则包括犯罪地法院管辖和被告人
