双方商定的流转费归流转方所有。土地流转协议其实就是一种民事合同，合同双方在完全自愿的情况下，达成一致的意向，并且二者之间的合同不容许第三人干涉，这是法律赋予合同最基本的保护。
在土地流转合同中，任何组织和个人不得擅自截留、扣留流转费，以保障承包方流转土地承包经营权的收益不被侵犯。
根据我国《农村土地承包法》第36条的规定，土地承包经营权流转的转包费、租金、转让费等，应当由当事人双方协商确定。村委会只能调解，而没有权力决定双方之间土地流转的具体收益标准。
附：2012年11月5日，民政部网站公布由中纪委、中组部和民政部等12个部委联合印发的《关于进一步加强村级民主监督工作的意见》。
村委会成员任期和离任都须接受经济责任审计。农村除由村民投票选出村“两委”外，还将设立村务监督委员会，制约并监督村干部处置村集体财产的权力。
设村务监督委员会负责村民民主理财和村务公开，是《意见》的亮点之一。民政部基层政权司相关负责人介绍，村委监督机构成员由民主推选3至5人，独立行使监督权，向村民会议和村民代表会议负责，监督村级重大事项决策程序和落实情况;村务公开以及村集体财产的管理、处置;村委会成员履职任职及廉洁自律等情况，并有权否决不合理开支。
《意见》鼓励群团组织负责人、村民小组长和村民代表，通过民主推选兼任村务监督机构成员，提倡村党组织成员兼任村务监督机构成员，但村委会成员及其近亲属、村会计(村报账员)、村文书不得担任村务监督机构成员。
为规范村委会的廉洁，《意见》要求，有财务审批权，或参与村经济活动决策的村委会成员，都要接受任期和离任经济责任审计。审计由县级农业、财政部门或乡级政府组织实施。村民如有异议，1/5以上村民联名，也可要求委托专业机构再审。
经济责任审计的内容包括：集体资产的管理使用、财务预决算、财务收支、生产经营和建设项目的发包管理、集体的债权债务、政府划拨或接受社会捐赠的款物使用等。审计发现村委会成员确实存在侵占集体资产、资金、资源等情况，可责令其如数退赔;构成违法或犯罪的，将依法移送有关部门处理。
《意见》提出目标，到2020年，我国要实现村级民主监督制度完善、形式丰富，民主评议有效，经济责任审计规范，切实保障农民的知情权、参与权、表达权和监督权。
土地流转补偿标准的相关内容。文章详细列举了征收不同性质的土地，如耕地、基本农田、林地等，以及各种用途的集体建设用地的补偿标准。同时，还介绍了其他税费、房屋补偿以及其他地上附着物的补偿标准。
合作开发协议的细节内容，包括合作方式、投资步骤与条件、土地拆迁、土地证办理、规划事宜、二期开发以及债权债务等方面。协议明确了甲、乙双方的出资方式、投资金额、资金用途及时机，以及双方在项目中的职责与风险。摘要字数控制在150字以内。
土地承包经营权转包合同的必备内容，包括当事人信息、流转期限和签订日期、流转费及支付方式和协议变更和合同解除等。文章还提供了一个合同范本，包括转包土地基本情况、用途、期限、交付日期、价格和支付方式等细节。
土地承包经营权确认纠纷的相关法律规定和土地承包经营权的流转方式。纠纷涉及土地承包经营权的成立、归属和内容等争议，当事人可通过协商、调解、仲裁或诉讼解决。流转方式包括转包、出租、互换、转让和入股等，根据双方需求和实际情况选择。
