根据《最高人民法院关于审理著作权民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》，侵犯著作权的诉讼时效为两年，计算起始日期为著作权人知道或应当知道侵权行为之日。如果权利人超过两年起诉，但侵权行为在起诉时仍在持续且在著作权保护期内，人民法院应判决被告停止侵权行为，并从权利人起诉之日向前推算两年计算侵权损害赔偿数额。
诉讼时效制度的核心在于权利人在知道或应当知道民事权利被侵犯后的三年内向人民法院提起保护民事权利的诉讼请求。换句话说，权利人应主动积极维护合法权益，超过三年的诉讼时效期间，权利人提起保护民事权利的诉讼请求将不受人民法院的保护。然而，最高人民法院的解释规定侵犯著作权的诉讼时效不适用《中华人民共和国民法总则》规定的诉讼时效制度。
根据最高人民法院的解释，权利人超过两年起诉，但侵权行为在起诉时仍在持续且在著作权保护期内，人民法院应判决被告停止侵权行为，并从权利人起诉之日向前推两年计算侵权损害赔偿。这意味着权利人可以无视诉讼时效制度，在著作权保护期内提起诉讼，只要侵权行为仍在持续，人民法院仍可支持权利人的请求，并判决权利人获得自起诉之日起向前推算两年的侵权损害赔偿。
最高人民法院的这一解释将侵犯著作权的诉讼时效限定在著作权保护期内，并在法律上延长了诉讼时效。然而，这种放弃诉讼时效的规定可能导致权利人维权意识的消极和权利的滥用。
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