根据《中华人民共和国民法总则》的相关规定，施工单位在追讨工程款时受到时效限制。一般情况下，追讨工程款的时效为三年，计算起始点是从施工单位知道工程款被拖欠的那一天开始。
根据《中华人民共和国民法总则》第一百八十八条的规定，请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。如果法律另有规定，将依照该规定执行。
诉讼时效期间的计算起始点是权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人的那一天。如果法律另有规定，将依照该规定执行。但是，如果权利受到损害之日起超过二十年，人民法院将不予保护；但如果存在特殊情况，人民法院可以根据权利人的申请决定延长时效期间。
追讨工程款需要准备以下证据：
这是施工单位的资质证明，用于证明其具备从事相关工程的资格。
这些文件用于证明工程的招标过程，包括招标公告、投标文件等。
这些文件用于证明工程已经按照相关规定进行了报建、规划、国土和施工许可的程序。
这些文件用于证明施工单位与建设单位之间的合同关系，包括承包合同和补充协议。
这些图纸用于证明工程的设计和施工方案。
这些文件用于证明工程延误或无法进行的原因，以及由此造成的损失。
这些记录用于证明工程的进度情况和施工过程中的重要事件。
这些签证用于证明工程量的增减情况，以及相应的费用调整。
这些文件用于证明工程设计的变更情况。
这些证明文件用于证明工程的质量已经通过验收。
这些凭据用于证明工程进度款项的支付情况。
这些文件用于证明工程的分包情况。
这些文件用于证明工程的最终决算或分阶段结算情况。
上述证据都应在诉讼前就已经准备齐全，因此在施工过程中需要注意收集和管理这些证据材料。
为确保证据的有效性，建议以书面形式将工程施工的情况固定下来：
1. 对于发生设计变更的情况，必须保存相关设计单位和规划部门的书面原件。
2. 施工过程中与建设单位或监理单位进行的会议记录等应由各方参会人员签字并妥善保存。
3. 如果工期延长，应立即与建设单位等书面确定延长的原因和处理办法，以防止建设单位以非施工单位原因拒绝支付或追究违约责任。
4. 如果连续多日出现大雨或其他恶劣天气导致工程无法进行，应让建设单位或监理单位进行签证工作。对于被拒绝签证的情况，应将原始资料和相关证明材料保存备查，以便日后索赔。
根据《中华人民共和国民法典》的规定，自2021年1月1日起，请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。如果法律另有规定，将依照该规定执行。
诉讼时效期间的计算起始点是权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人的那一天。如果法律另有规定，将依照该规定执行。但是，如果权利受到损害之日起超过二十年，人民法院将不予保护。然而，在特殊情况下，人民法院可以根据权利人的申请决定延长诉讼时效期间。
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