当在民事诉讼中，对方以超过诉讼时效进行抗辩时，当事人可以采取以下措施来处理：
当事人可以收集与诉讼时效中断、中止等相关的证据，以证明对方的抗辩是不合法的。
根据《中华人民共和国民法总则》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。如果法律有其他规定，应依照其规定执行。
诉讼时效期间的计算起点是自权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起。如果法律有其他规定，应依照其规定执行。但是，如果超过二十年自权利受到损害之日起，人民法院将不予保护。特殊情况下，人民法院可以根据权利人的申请决定延长诉讼时效期间。
根据《中华人民共和国民法总则》第一百九十五条的规定，以下情形之一发生时，将导致诉讼时效中断，从中断、有关程序终结时起，诉讼时效期间将重新计算：
债权人中断诉讼时效的方法，包括提出履行要求、请求保护民事权利以及报案或控告等方式，依据《民法总则》相关规定执行。中断情形包括权利人向义务人提出履行请求、提起诉讼或申请仲裁等，从中断开始或相关程序终结时起，诉讼时效期间重新计算。
时效中断的举证问题，针对现行法律对于被告抗辩时间限制的不明确，导致债务人在一审未提出时效抗辩而败诉，二审中又以诉讼时效超过为由上诉的情况。在审查时效中断问题时，债权人可能主张时效已中断，但债务人常以证据不属于新证据且超过举证时限为由拒绝质证。当前解决
诉讼时效制度的概念及其在实际中的应用。文章指出，债权人在债务到期后应积极行使权利，否则超过诉讼时效将失去法律保障。文章还介绍了《民法通则》中的相关法条和案例，提醒债权人及时行使权利，并介绍了律师在其中的帮助作用。最后提出了债权超过诉讼时效的解决方法。
追诉期的含义和适用范围，包括不同犯罪行为的追诉期限和不同情况下的追诉期限计算方式。同时，文章还介绍了事实劳动关系的认定与法律适用，包括事实劳动关系在劳动争议处理和工伤认定工作中的重要性，以及相关法律法规对事实劳动关系的认定和规定。
