当在民事诉讼中，对方以超过诉讼时效进行抗辩时，当事人可以采取以下措施来处理：
当事人可以收集与诉讼时效中断、中止等相关的证据，以证明对方的抗辩是不合法的。
根据《中华人民共和国民法总则》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。如果法律有其他规定，应依照其规定执行。
诉讼时效期间的计算起点是自权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起。如果法律有其他规定，应依照其规定执行。但是，如果超过二十年自权利受到损害之日起，人民法院将不予保护。特殊情况下，人民法院可以根据权利人的申请决定延长诉讼时效期间。
根据《中华人民共和国民法总则》第一百九十五条的规定，以下情形之一发生时，将导致诉讼时效中断，从中断、有关程序终结时起，诉讼时效期间将重新计算：
抗辩权的法律概念和定义，包括广义和狭义之分。不同学者对抗辩权的定义存在差异，而我国的法律主要从狭义角度来理解和规定抗辩权。文章将讨论狭义上的抗辩权的适用范围，包括诉讼时效已过的抗辩权等。了解抗辩权的概念和相关法律规定，有助于更好地运用抗辩权。
保证人追偿权的诉讼时效及条件。担保人承担担保责任后才有追偿权，且必须在诉讼时效期间内行使。担保人承担担保责任时主观上不能有过错，否则不能向主债务人追偿。如果保证人在可以主张诉讼时效抗辩权而没有主张时清偿了债务，则不能再向债务人追偿。具体问题应咨询专业
在特定情境下中断诉讼时效的行为和哪些情形不适用诉讼时效。中断诉讼时效的行为包括权利人提起诉讼或申请仲裁、权利人向义务人提出履行请求等。而不适用诉讼时效的情形则包括人身权的请求权、财产性支配权、抗辩权等。此外，存款本息的请求权和对国家和金融机构信赖购买
中国法律中撤诉对诉讼时效的影响。对于起诉后撤诉是否导致诉讼时效中断的问题，我国法律并没有明确规定。本文从撤诉后重新起诉的角度阐述了诉讼时效不中断的理由，包括促使当事人及时行使权利的目的、撤诉是对起诉的完全否定以及避免滥用诉讼权利的原则。
