根据《人民检察院刑事诉讼规则》第五百一十五条的规定，犯罪嫌疑人、被告人通过实施犯罪直接或间接获得的任何财产都应被认定为“违法所得”。如果违法所得部分或全部转变、转化为其他财产，那么转变、转化后的财产也应视为违法所得。同样，来自违法所得转变、转化后的财产收益，或者来自已经与违法所得相混合财产中违法所得相应部分的收益，也应被视为违法所得。
根据该办法，工商行政管理机关认定违法所得的基本原则是：以当事人违法生产、销售商品或提供服务所获得的全部收入扣除当事人直接用于经营活动的适当的合理支出，为违法所得。当然，本办法对特殊情况有特殊规定。
具体来说：
违法生产商品的违法所得应按违法生产商品的全部销售收入扣除生产商品的原材料购进价款来计算。
违法销售商品的违法所得应按违法销售商品的销售收入扣除所售商品的购进价款来计算。
违法提供服务的违法所得应按违法提供服务的全部收入扣除该项服务中所使用商品的购进价款来计算。
违反法律、法规的规定，为违法行为提供便利条件的违法所得应按当事人的全部收入计算。
在违法承揽的案件中，如果承揽人提供材料，那么违法所得应按照本办法第三条计算；如果定做人提供材料，那么违法所得应按照本办法第五条计算。
在传销违法活动中，如果是拉人头、骗取入门费式传销，违法所得应按当事人的全部收入计算；如果是团队计酬式传销，并且销售的是自产商品，那么违法所得应按违法销售商品的收入扣除生产商品的原材料购进价款计算；如果销售的是非自产商品，那么违法所得应按违法销售商品的收入扣除所售商品的购进价款计算。
在违法所得认定时，对当事人在工商行政管理机关作出行政处罚前依据法律、法规和省级以上人民政府的规定已经支出的税费，应予扣除。
总之，本办法适用于工商行政管理机关行政处罚案件中对“非法所得”的认定。如果法律、行政法规或政府规章另有规定，应从其规定中进行认定。
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