根据第120条的规定，对于组织、领导、参加恐怖组织，并利用该组织实施杀人、爆炸、绑架等犯罪的行为，应予以追究和惩罚。
对于走私犯罪并以暴力、威胁的方法抗拒缉私的行为，应根据具体的走私犯罪与妨害公务罪进行并罚。需要注意的是，根据第157条第2款的规定，走私犯罪不包括走私毒品罪。然而，根据第347条的规定，在走私毒品的犯罪过程中，如果以暴力抗拒检查、拘留、逮捕，并且情节严重，应直接以走私毒品罪的加重情形来处理，不实行并罚。
对于为保险诈骗而故意制造财产损毁、被保险人死亡、残疾或疾病等保险事故的行为，根据第198条的规定，应予以追究和惩罚。
对于收买被拐卖的妇女儿童之后又有非法剥夺、限制其人身自由、伤害、强奸、侮辱行为的行为，应予以追究和惩罚。
对于为实施其他犯罪（盗窃罪除外）而偷开机动车辆作为犯罪工具并将机动车辆据为己有或丢失的行为，应予以追究和惩罚。
对于组织、领导、参加黑社会性质组织或者入境发展黑社会组织，并利用该组织而犯其他罪行的行为，应予以追究和惩罚。
对于组织、运送他人偷越国边境，并对被组织、运送人有杀害、伤害、强奸、拐卖等犯罪行为的，或对检查人员有杀害、伤害等罪行的行为，应予以追究和惩罚。
对于实施第140至148条的生产、销售伪劣商品以及假药等特定伪劣产品犯罪行为，并以暴力、威胁方法抗拒查处的行为，应予以追究和惩罚。
对于出售、运输假币构成犯罪，并且又使用假币的行为，应予以追究和惩罚。
对于犯非法猎捕、杀害珍贵、濒危野生动物罪，非法收购、运输、出售珍贵、濒危野生动物及其制品罪，以及非法狩猎罪，并且又以暴力、威胁方法抗拒查处的行为，应予以追究和惩罚。根据第341条的规定，可以同时以第341条的罪与妨害公务罪等进行并罚。
对于挪用公款进行非法活动构成其他犯罪的，或者因挪用公款而索取、收受贿赂构成犯罪的行为，应予以追究和惩罚。
对于纳税人缴纳税款后，采取假报出口或其他欺骗手段，骗取国家出口退税款的行为，应以偷税罪定罪处罚。如果骗取的税款超过所缴纳的税款部分，应以骗取出口退税罪定罪处罚，并且要进行数罪并罚。
对于非法行医又非法实行节育手术的行为，应予以追究和惩罚。
对于猎捕、收购、运输、出售野生动物又抗拒检查或走私出境的行为，应予以追究和惩罚。
职务犯罪与严重违纪的定义以及玩忽职守罪的具体规定。职务犯罪包括贪污、贿赂等侵犯公民权利、破坏公务活动规章规范的行为，应予以刑事处罚。玩忽职守罪具体表现为国家机关工作人员滥用职权或玩忽职守，造成重大损失等情形。此外，文章还涉及了渎职犯罪与受贿罪数罪并罚
判决宣告前犯数罪的刑期决定方式及相关问题。对于一人犯数罪的情况，除死刑和无期徒刑外，应基于数罪的总刑期和最高刑期来决定执行的刑期。有期徒刑和拘役的执行顺序以及附加刑的执行也有所涉及。同时，文章还涉及判决宣告后新发现罪行和再次犯罪的判决执行的规则。
数罪并罚的定义、原则及计算方法。数罪并罚指的是一个人多次犯罪，审判机关根据刑法规定的原则和方法进行合并处罚。数罪并罚的原则包括吸收原则、限制加重原则和并科原则。文章还介绍了数罪并罚的三种情况和具体的计算方法。
犯罪分子数罪并罚的判决原则。对于数罪中的每一种犯罪，法院会分别判决，若其中有死刑或无期徒刑，则执行相应刑罚。有期徒刑、管制和拘役的刑期有上限。量刑时，法院会先对每种犯罪分别量刑，再将各罪刑罚相加得到总和刑期，并在数罪中的最高刑期和总和刑期之间决定执行
