人民检察院在对诉讼活动实行法律监督中发现的司法工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、非法搜查等侵犯公民权利、损害司法公正的犯罪，可以由人民检察院立案侦查。对于公安机关管辖的国家机关工作人员利用职权实施的重大犯罪案件，需要由人民检察院直接受理的时候，经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院立案侦查。
《刑事诉讼法》
第十九条 刑事案件的侦查由公安机关进行，法律另有规定的除外。
人民检察院在对诉讼活动实行法律监督中发现的司法工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、非法搜查等侵犯公民权利、损害司法公正的犯罪，可以由人民检察院立案侦查。对于公安机关管辖的国家机关工作人员利用职权实施的重大犯罪案件，需要由人民检察院直接受理的时候，经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院立案侦查。
自诉案件，由人民法院直接受理。
指定管辖的含义和实质，即上级人民法院以裁定方式指定下级人民法院对某一案件行使管辖权，旨在适应审判实践的需要，保证案件及时正确裁判。文章还涉及处理指定管辖的管辖权异议、刑事诉讼中的管辖规定以及刑事案件指定管辖制度等内容。
刑事自诉案件的诉讼费用问题。刑事自诉案件是轻微刑事案件，被害人可直接向法院提起，无需支付费用。诉讼费用包括受理费和其他费用。提起刑事自诉需满足有适格自诉人、明确被告人及请求、属于自诉案件范围、被害人有证据证明和属于受诉法院管辖等条件。
我国《刑事诉讼法》规定的检察院审查起诉期限。一般情况下，案件审查起诉阶段最长为6个月。对于重大复杂案件或需要补充侦查的案件，可适当延长。改变管辖的案件审限最长为8个月。审查期限的设定考虑了司法机关的办案水平和实际需要，以确保案件审理的准确性和效率。
关于没收程序的管辖权问题。依据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关解释，没收财产的判决由人民法院执行，必要时可与公安机关共同执行。财产刑和附带民事裁判由一审法院负责裁判执行的机构执行。因此，违法所得没收的执行程序应由一审法院管辖。
