一是把好合同审查关。工程结算审计应严格执行招投标文件和合同的规定;合同条款与招投标文件实质性内容相违背的，执行招投标文件;两份合同相矛盾的，执行后一份合同;合同价有下浮的，审定结算价应按相同比率下浮。
二是把好工程量计算关。审查有无多计、重复计算以及只计增项不减项的工程量，审查工程量计算规则是否正确。
三是把好定额套用审核关。相同项目是否执行投标单价，投标书中没有的项目是否高套或错套定额。
四是把好材料价格审核关。相同材料是否执行投标价，投标书中没有的材料是否执行合同价或参照同期信息价及市场询价，价格波动大的主要材料还应按照合同和相关文件规定的风险系数进行调整。
五是把好工程签证审核关。审查签证手续是否齐全，有无建设、施工、监理部门签字，设计变更签证有无设计部门签字盖章及相关审批手续;在取费或定额含量中已包含的签证是否重复计取;对有疑问的签证要实地勘察、逻辑推理，必要时要开挖钻孔。
六是把好取费标准审核关。审查各项取费计算的基数是否符合取费文件和合同的规定，是否与投标书一致。
审计过程中关于确认、评价与控制或有负债的相关方针、政策和工作程序。审计师需向被审计单位管理当局了解相关事项，获取相关文件和凭证，并与银行、法律顾问和律师进行函证。同时，还需复核税务报告、会议记录和审计工作底稿等，以确定会计报表披露的或有负债是否恰当，
同级财政审批的各年度财务决算报表及竣工财务决算报表;单项工程竣工后，承包人应在提交竣工验收报告的同时，向发包人递交竣工结算报告及完整的结算资料，发包人应按以下规定时限进行核对(审查)并提出审查意见。
建设、施工等与建设项目相关的单位应提供的资料：。经批准的可行性研究报告，初步设计、投资概算、设备清单;工程预算、结算书;同级财政审批的各年度财务决算报表及竣工财务决算报表;
工程结算审计，一般是由工程造价事务所和会计师事务所中介机构完成。工程量是决定工程造价的主要因素，核定施工工程量是工程竣工结算审计的关键。因此，作好隐蔽工程验收记录是进行工程结算的前提。工程合同审计是投资审计的一项重要内容，必须仔细查阅相关文件资料是否
