根据刑事诉讼法第二百八十条规定，违法所得的没收程序仅适用于贪污贿赂重大犯罪案件和恐怖活动重大犯罪案件。其他案件不适用该程序。在上述两类案件中，只有满足以下条件之一才能启动违法所得没收程序：犯罪嫌疑人或被告人逃匿在通缉后一年内不能归案，或者犯罪嫌疑人或被告人死亡。
重大犯罪案件的定义根据最高人民法院司法解释，包括可能被判处无期徒刑以上刑罚的案件，或者在本省、自治区、直辖市或全国范围内有较大影响的案件，或者其他重大犯罪案件。重大犯罪案件的判断标准包括量刑幅度和案件影响力。例如，贪污、贿赂金额超过10万元的案件被视为重大犯罪案件。然而，对于案件影响力并没有明确的标准，这可能导致司法裁量的主观性。
根据刑事诉讼法和最高人民法院的司法解释，应当予以没收的财产包括违法所得和涉案其他财产。违法所得是指犯罪行为所取得的财产及其孽息，例如贪污、受贿所得等。涉案其他财产是指犯罪嫌疑人或被告人非法持有的违禁品或供犯罪所用的本人财物。涉案其他财产的限定条件是该财物必须是供犯罪所用且属于犯罪嫌疑人或被告人所有。如果犯罪嫌疑人或被告人将自己的房屋作为犯罪的聚集点，该房产可能会被依法没收。
违法所得没收程序包括以下步骤：
(1)申请的提出：由犯罪地或犯罪嫌疑人、被告人居住地的市一级检察院向对应的中级法院提出没收违法所得的申请。如果被告人在审理过程中死亡，原审理法院也可以受理申请。
(2)法院审查、受理：法院应在7日内审查完毕申请，并决定是否受理。如果决定受理，法院应在十五日内发出公告，公告期为六个月。公告范围包括在全国公开发行的报纸或法院的官方网站上刊登，并在法院公告栏张贴、公示。如果法院已经掌握犯罪嫌疑人或被告人近亲属和其他利害关系人的联系方式，应直接告知并记录在案。
(3)犯罪嫌疑人、被告人近亲属、其他利害关系人参加诉讼：上述人等应在公告期内申请参加诉讼，并可以委托代理人。其他利害关系人是指对申请没收的财产主张所有权的人。
(4)审理：公告期满后，法院应组成合议庭进行审理。根据不同情况，法院会作出没收或驳回申请的裁定。
(5)终止审理情形：如果犯罪嫌疑人或被告人归案，应当终止审理。
(6)不服没收或驳回申请裁定的救济：如果对没收财产的裁定不服，犯罪嫌疑人、被告人近亲属或其他利害关系人可以在收到裁定书之日起五日内提起上诉；检察院对驳回申请的裁定不服，也可以在五日内提出抗诉。如果没收违法所得的裁定生效后，犯罪嫌疑人或被告人到案并提出异议，法院应根据情况维持或撤销原裁定，并对涉案财产作出处理。已生效的没收违法所得裁定可以依照审判监督程序予以纠正。
总的来说，刑事诉讼法规定的违法所得没收程序对于打击贪污贿赂和恐怖活动犯罪具有重大意义。
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