拖欠工程款和借款是两种不同的法律关系，事实上是拖欠工程款产生纠纷的，是不能按借款协议起诉的，起诉了法院也可能不受理。
《中华人民共和国民事诉讼法》
第一百一十九条 起诉必须符合下列条件：
(一)原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织;
(二)有明确的被告;
(三)有具体的诉讼请求和事实、理由;
(四)属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
第一百二十条 起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。
1、发包方拖欠工程款违约纠纷
这种违约纠纷的特点是，工程款是可以确定的，故这种纠纷法律比较简单。这类纠纷形成的主要原因发包方没有任何正当理由违约拖欠，主要表现为的发包方无力支付工程款;发包方有支付能力无故拖欠工程款。
2、关于总包、分包问题引起的工程款纠纷
这种纠纷法律关系较为复杂。这种纠纷主要表现为承包方分包在程序上有瑕疵，发包方事后不予承认分包合同的合法性，从而引起的纠纷。
3、竣工结算报告争议引发的工程款纠纷
这种纠纷主要表现为：承包方制作结算文件递交发包方，未取得递交结算文件的证据，发包方不予答复且事后不承认收到;承包方制作结算文件递交发包方，发包方不予答复;承包方制作结算文件递交发包方，发包方不予认可而引发的工程款结算纠纷。
4、建筑材料品质之争引起的工程款纠纷
这种表现纠纷主要表现为：建设工程招投标时对工程主要建筑材料品质有所要求或承诺，但由于建筑材料市场供求关系的影响，有时使得承包方转而采用合同外的其他建材，引起结算纠纷。
5、质保金纠纷
该类纠纷主要表现为建设工程竣工后出现维修事项，承包人在保修期内履行了维修义务但无法直接取得证据，发包方事后不予承认维修事实以承包方未尽保修义务为由拒不支付工程款引发了纠纷。
借款协议金额修改、民间借贷利息问题等方面的有效性问题。合同变更需双方协商一致，单方面私自修改无效。未约定利息的民间借贷可视为无偿借贷。利率标准争议可在银行同类贷款利率的4倍标准内确定。超过年利率36%的利息约定无效。复利计算受法律限制，出借人不得将利
乡政府拖欠工程款的法律解决途径。施工方可以与乡政府协商解决或向法院提起诉讼。承包人可请求解除建设工程施工合同的情形包括未按约定支付工程价款等。合同争议可通过和解、调解、仲裁解决。工程欠款的利息追讨应按合同约定或按中国人民银行发布的同期同类贷款利率计息
借款过程中约定的劳务费是否能认定为借款利息的争议问题。彭某向吴某借款20万元并承诺每月支付劳务费4000元，引发分歧。作者同意第二种意见，认为劳务费与借款利息不同，借款合同中不能约定劳务费，约定的劳务费应认定为借款利息。从借款合同的目的和保证担保人履
承包单位向人民法院主张工程款的，起诉的时效是3年，从知道建设单位拖欠工程款之日起开始计算。第一百八十八条 向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护;有特殊情况的，
