港口仓储合同的纠纷适用专属管辖，即由港口所在地人民法院管辖。专属管辖是指法律强制规定某类案件只能由特定法院管辖，其它法院无权管辖，也不允许当事人协议变更管辖。与其他法定管辖相比，专属管辖具有优先性、排他性与强制性。专属管辖是法院管辖独有的制度，仲裁没有专属管辖。
专属管辖有分为国内专属管辖与涉外专属管辖。
国内专属管辖的范围如下：
涉外专属管辖的范围如下：
根据我国《民事诉讼法》第266条规定，属于我国人民法院专属管辖的涉外民事案件有：
此外，根据国际私法的理论和实践，下列情形发生的案件，也应当专属人民法院管辖：
而因继承遗产纠纷提起的诉讼，情形比较复杂，一般不作为专属管辖对待。
我国除设有普通法院之外，还设有一些专门法院，如海事法院、军事法院、铁路运输法院等，这些法院也管辖部分第一审民事案件：如海事法院受理当事人因海事侵权纠纷、海商合同纠纷及法律规定的其他海事纠纷提起的诉讼；军事法院受理双方当事人都是军队内部单位的经济纠纷案件；铁路运输法院受理铁路货物运输、旅客运输等的合同纠纷案件、对铁路造成损害的侵权纠纷案件。虽然这些专门法院有特定的受案范围，它们所受理的案件也具有专属性，但这种专属性与专属管辖不同。
另外，在专门法院受理的案件中，有时也存在着专属管辖与非专属管辖之分，例如《中华人民共和国海事诉讼特别程序法》（以下简称《海事诉讼特别程序法》）就对一些案件规定了专属管辖。
专属管辖与一般管辖的区别。专属管辖具有法律明确规定、排他性、不受地域限制等特点，分为国内和涉外两类。国内专属管辖适用于不动产、港口作业和继承遗产等纠纷，而涉外专属管辖适用于中外合资、合作企业和资源勘探开发等合同纠纷。这些案件只能由规定的专门人民法院受
当事人通过书面协议选择管辖法院的相关内容。在合同或其他财产权益纠纷中，当事人可选择与争议有实际联系的地点的人民法院作为管辖法院，包括被告住所地等。但这种选择不得违反法律对级别管辖和专属管辖的规定。专属管辖具有特定的效力。
涉外民事诉讼的管辖权问题。其中，一般地域管辖由被告住所地人民法院行使，若被告住所地与经常居住地不符则由经常居住地法院管辖；特殊地域管辖适用于境内合同纠纷等诉讼；协议管辖允许双方约定某一法院行使管辖权；默认管辖视为被告对法院管辖权的承认；专属管辖规定了
关于给付工程款纠纷的管辖问题。工程合同纠纷按照不动产纠纷确定管辖，属于专属管辖范围。对于工程款垫资约定不明的纠纷，承包人可以通过协商追偿和将工程项目相关方一并起诉法院的方式追回款项。
