根据《民法典》规定，借款合同中违约金的诉讼时效为三年。根据第一百八十八条的规定，请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，除非法律另有规定。
诉讼时效期间的计算从权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起开始。根据特殊情况和法律规定，人民法院可以根据权利人的申请决定延长诉讼时效期间。然而，如果权利受到损害之日起已经超过二十年，人民法院将不予保护。
如果当事人约定同一债务分期履行，诉讼时效期间从最后一期履行期限届满之日起开始计算。
对于无民事行为能力人或限制民事行为能力人对其法定代理人的请求权，诉讼时效期间从法定代理终止之日起计算。
对于未成年人遭受性侵害的损害赔偿请求权，诉讼时效期间从受害人年满十八周岁之日起计算。
诉讼时效期间届满后，义务人可以提出不履行义务的抗辩。然而，如果义务人同意履行或已经自愿履行，就不能以诉讼时效期间届满为由抗辩或请求返还。
根据第一百九十三条的规定，人民法院不得主动适用诉讼时效的规定。
在诉讼时效期间的最后六个月内，因不可抗力、无民事行为能力人或限制民事行为能力人没有法定代理人、继承开始后未确定继承人或遗产管理人、权利人被义务人或其他人控制以及其他导致权利人不能行使请求权的障碍，诉讼时效可以中止。中止时效的原因消除之日起满六个月后，诉讼时效期间届满。
综上所述，借款合同中的违约金是由双方约定的，一方不履行合法条款将承担相应责任。如果双方无法通过协商解决争议，可以通过诉讼方式解决。然而，诉讼时效是非常重要的，必须在规定的时效内办理。一旦超过时效，自己的胜诉权将无法得到保护。
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