根据《破产法》第２１条的规定，破产债权确认纠纷应该由受理破产申请的人民法院管辖，这属于一般性的规定，理论上应该属于专属管辖。对于这个一般性的规定，还有一些例外。
１、如果债权人和破产债务人对债权债务纠纷约定了仲裁，那么当管理人对该债权不予确认登记时，债权人就应当向仲裁委提出债权确认申请，受理破产的法院没有管辖权。
２、实践中，破产案件一般由中级人民法院受理。如果破产债权确认之诉数量庞大，标的较小，争议简单的话，全部由中级法院审理，二审均由高级法院受理，不利于司法资源的有效配置。此时，受理破产申请的中级法院，可以利用《民事诉讼法》第３８条规定的管辖权转移制度，将本应由自己审理的案件，报请高级人民法院批准，交由基层人民法院审理。
《破产法解释二》第四十七条第二款也给予了肯定。具体操作时，职工破产债权确认纠纷可以全部交由基层人民法院审理，普通破产债权确认纠纷可以根据标的额，按级别管辖的规定本应由基层人民法院审理的案件，交基层人民法院审理。破产案件由受理破产申请的法院专属管辖，是为了实现集中审理，因此，在将案件指定基层人民法院审理时，应当指定唯一的基层人民法院，例如可以是破产债务人住所地的基层法院。
报请高级人民法院批准，也无需一案一报，可以在受理破产申请时，提出方案，报请高院统一批准。以后出现破产债权确认纠纷时，按方案确定审理法院。但是立案还是应当由受理破产申请的中级法院统一立案，便于统计管理。
３、破产债权确认纠纷拟确认的债权，如果属于海事纠纷、专利纠纷、证券市场因虚假陈述引发的民事赔偿纠纷等须专门管辖的案件，则此类案件由受理破产的法院集中审理，就未必有利。此时较好的做法是由上级人民法院指定一家有权管辖此种专业案件的法院，集中审理类似案件。对此，《破产法解释二》第四十七条第三款给予了肯定。
二、破产债权申报时间是什么时候
从法院受理破产申请公告之日起计算，最短不少于三十天，最长不超过三个月。依据《破产法》第４５条的规定，人民法院受理破产申请后，应当确定债权人申报债权的期限。债权申报期限自人民法院发布受理破产申请公告之日起计算，最短不得少于三十日，最长不得超过三个月。
三、担保人破产债权申报要什么手续１、申请书。应根据法律相应规定，说明债务人拖欠申请人债务、不能清偿到期债务，债务人已符合破产条件，申请人因此以债权人资格申请宣告债务人破产。
２、申请人资格证书、营业执照、身份证明。
３、债权性质、数额、有无财产担保情况并附相应证据。
４、债务人不能清偿到期债务，且已呈持续状态的有关证据。
５、审计报告。（非硬性要求）可以提交债务人在工商行政管理机关和税务机关存档的审计报告。
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引用法条
[1]《中华人民共和国企业破产法》第二十一条 [2]《中华人民共和国企业破产法》第四十五条 [3]《中华人民共和国民事诉讼法》第三十八条 [4]《最高人民法院关于适用《中华人民共和国企业破产法》若干问题的规定（二）》第四十七条
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