在存单质押被查封后，可以采取以下方法解决问题：
1. 提起民事诉讼：当事人可以要求银行向当地人民法院提起民事诉讼，以解决存单项下的存款权利问题。
2. 存款权利确权：人民法院可以对存单项下的存款权利进行确权，确认存款的所有权归属。
3. 协调执行程序：在申请执行环节，执行法院之间可以进行协调，以使存单解付进入母账户。
4. 解封母账户并扣收贷款：执行法院可以暂时解封母账户，并从中扣收贷款。
上述解决方法的法律依据是《民事诉讼法》第二百三十六条，该条规定了执行开始的方式：
1. 发生法律效力的民事判决、裁定，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行，也可以由审判员移送执行员执行。
2. 调解书和其他应当由人民法院执行的法律文书，当事人必须履行。一方拒绝履行的，对方当事人可以向人民法院申请执行。
根据上述法律规定，被查封的存单的所有权归属问题可以通过提起民事诉讼来解决。同时，在申请执行的过程中，执行法院之间可以进行协调，以确保存单解付进入母账户，并临时解封母账户以扣收贷款。
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