工程档案的保管期限

根据档案的保存期限原则，工程档案可以划分为永久保存、长期保存和短期保存三种。

工程档案包括土建技术、质量、安全、经营；水暖、电气、外分包等文件档案、电子档案和声像档案，被列为永久保存。

档号编制原则

档号是用于存取档案的代号，也是排架的依据。它反映了公司档案的分类体系和物理位置。档号的编制必须符合唯一性、合理性和稳定性要求，并且能够适应计算机档号编制方法。

档号的基本结构由公司标志、分类号、年度号和案卷号组成。

档案存放和登记

工程档案一律存放在柜内，按照工程竣工时间分区，按照工程分类和专业分号进行整齐存放。同时，需要填写《竣工档案登记明细表》，其中包括档案号、竣工时间、工程名称、专业和顺序号。

工程合同的有效期

根据《建设工程质量管理条例》第40条的规定，建设工程的保修期从竣工验收合格之日起计算。

根据《建设工程质量保证金管理办法》第8条的规定，质保期从工程通过竣工验收之日起计算。如果由于承包人的原因导致工程无法按规定期限进行竣工验收，质保期从实际通过竣工验收之日起计算。如果由于发包人的原因导致工程无法按规定期限进行竣工验收，在承包人提交竣工验收报告90天后，工程自动进入质保期。

综上所述：

1. 在工程正常竣工验收合格的情况下，保修期和质保期的起算时间一致。
2. 如果工程无法正常验收，则质保期按照《建设工程质量保证金管理办法》第8条的规定起算即可。但是，法律并没有明文规定保修期的起算时间。根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第14条的规定，可以推定如下：
1. 如果承包人已经提交竣工验收报告，而发包人拖延验收，那么竣工日期应以承包人提交验收报告的日期为准，保修期从该日期起算。
2. 如果建设工程未经竣工验收，而发包人擅自使用，那么竣工日期应以转移占有建设工程的日期为准，保修期从该日期起算。
3. 如果由于承包人的原因导致建设工程无法完成竣工验收，那么保修期无法起算。