根据法律规定，人应当及时交货，收货人在提货时应当检验货物并及时提出异议。如果收货人没有在交货时进行检验并确认货物的质量和数量，那么事后很难再提供证据证明货物的短缺或损坏情况。因此，物流企业在接收货物时必须进行清点和检验，以免替其他公司背黑锅。如果在检验时发现货物与托运单或货物明细单不相符，应当由货主或承运人书面确认，否则收货后很难提供证据，只能自己承担货物损害赔偿责任。
根据合同约定，由哪一方负责装卸就由哪一方承担在装卸过程中造成的货物损失的赔偿责任。即使没有合同约定，在物流业务中通常由承运人负责一部分装卸工作，在出入仓、转车时也需要搬运货物，因此也可能发生货物损害，这些情况都会导致赔偿责任的产生。
在装卸过程中不仅可能导致货物损失，还可能发生人身损害事故，造成搬运工或其他人员受伤。因此，负责装卸的物流企业需要承担事故赔偿责任。
根据合同法的规定，保管人应当对保管物进行验收。在仓储业务中，如果保管人没有对货物进行逐一检验核实，就会导致货物出库时与入库时不相符，仓储公司可能被迫赔偿。
仓储物可能因为变质、损毁或灭失而导致赔偿责任。
一些存货人可能虚报货物数量，或者隐瞒货物的瑕疵，以次品冒充。在提货时，他们可能要求按照仓单交货，或以擅自调换货物为由要求赔偿。有的存货人为了节省费用故意隐瞒危险物品或其他需要另外储存的化学品，造成其他货物损失，导致仓储公司向其他存货人赔偿。但仓储公司要证明存货人的责任并向其追偿往往十分困难。
物流加工属于加工承揽合同，承揽人应当自己完成主要工作。否则，定作人可以解除合同。如果因转包造成损失，转包人要承担赔偿责任。
在物流加工环节，常常会把一些辅助性工作交给临时工去做。如果是临时雇佣关系，雇工在工作中造成伤害事故，物流公司作为雇佣方要对其承担赔偿责任。因此，建议物流公司在临时雇佣人员时签订承揽合同，以避免雇工的损害赔偿风险。
对于需要物流公司加工、分检、包装的货物，在接收货物时必须及时检验。否则，接收后出现质量问题就很难证明是货物本身存在质量问题，物流公司就要承担赔偿责任。
如果物流公司将加工业务外包给其他人，如果承揽人欺诈造成损失，物流公司就必须自己向定作方承担赔偿责任。
在配送合同中，常常对配送时间、迟延交货、误送等方面设定了苛刻的条件。由于配送业务量大、面广，时间跨度长，很难严格履行条款，因此经常面临赔偿损失的风险。因此，在签订配送合同时应允许配送人在配送时间、货损等方面有一定程度的误差，并设定一些配送人的免责条款。
在物流配送中，由于配送时间要求高，如果发生货损，往往会导致赔偿责任。因此，在签订配送合同时应设定一些免责条款，以降低赔偿风险。
由于物流公司经营货运代理业务较少，这部分风险不展开讨论。
保险可以说是企业最重要的风险防范底线。然而，如果不注意，保险也可能成为最大的风险。物流保险的风险主要包括保险合同无效、保险免则条款和保险索赔证据不足等。因此，在购买保险时要注意保险合同的有效性、免责条款和索赔手续的完备性。
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