我国劳动法第八十二条规定的申请仲裁期限制度以及劳动争议调解仲裁法第二十七条规定的申请仲裁的时效期间制度，与民法通则第七章规定的诉讼时效制度性质相同，均属于诉讼时效制度，而不是除斥期间。既然是同一性质的制度，就应当统一适用有关诉讼时效的司法解释。
2008年9月1日起施行的《最高人民法院关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》（下称《规定》），是最高人民法院为全国各级法院正确适用法律关于诉讼时效制度而进行的司法解释，普遍适用于涉及诉讼时效的民事审判。理论上讲，劳动仲裁审理涉及仲裁时效的劳动争议案件，也应适用该司法解释的相关原则或规定。
根据《规定》第三条规定，当事人未提出诉讼时效抗辩，人民法院不应对诉讼时效问题进行释明及主动适用诉讼时效的规定进行裁判。同样地，对于劳动法和劳动争议调解仲裁法中有关仲裁时效的规定，即审理劳动仲裁案件，不应对仲裁时效进行主动适用或释明。但被诉方提出时效抗辩后，仲裁和法院应如何选择适用相关法律的时效规定？
根据民法通则第一百三十五条规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为2年，法律另有规定的除外；劳动法第八十二条规定，提出仲裁要求的一方应当自劳动争议发生之日起60日内向劳动争议仲裁委员会提出书面申请；劳动争议调解仲裁法第二十七条规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为1年。
显然，劳动法和劳动争议调解仲裁法的这些规定属于民法通则第一百三十五条中的“法律另有规定”，应优先于民法通则的规定而适用。劳动法和劳动争议调解仲裁法在位阶上相同，都是人大常委会制定的，且两法有关仲裁时效的规定不存在一般与特别的区别，但劳动争议调解仲裁法是新法，其相关规定应优先于劳动法的规定而适用。即，审理劳动争议案件在涉及劳动仲裁时效问题，且被诉方就仲裁时效已提出抗辩的情况下，应优先适用劳动争议调解仲裁法的规定。
时效制度属于实体法律规范，不具有溯及既往的效力。劳动争议调解仲裁法的实施时间是2009年5月1日，在其实施之前发生的劳动争议在审理时适用劳动法有关仲裁时效的规定，在其实施之后发生的劳动争议在审理时适用劳动争议调解仲裁法有关时效的规定。即是以争议发生之日为基准日，而不是以案件受理之日或审理之日或裁决之日为基准日。
然而，《规定》属于司法解释，是依照民法通则、物权法、合同法、民事诉讼法等法律的规定，结合审判实践制定的，是对这些法律中诉讼时效制度的解释。所以，只要争议的事实发生在相关法律实施之后，且按相关法律的规定，应当适用该法的诉讼时效制度，该司法解释实施时案件尚在审理阶段，就应当适用该司法解释的规定。
现在审理的劳动争议仲裁案件，除极个别的外，争议发生的时间均晚于上述法律的实施时间，所以，劳动仲裁审理劳动争议案件，除极个别的外，应适用《规定》，不主动适用仲裁时效规定。《规定》第二十三条规定，本规定施行后，案件尚在一审或者二审阶段的，适用本规定；本规定施行前已经终审的案件，人民法院进行再审时，不适用本规定。
根据《规定》第四条规定，当事人在一审期间未提出诉讼时效抗辩，在二审期间提出的，人民法院不予支持，但其基于新的证据能够证明对方当事人的请求权已过诉讼时效期间的情形除外。同样地，如果在仲裁阶段当事人未提出时效抗辩，在一审诉讼时才提出该抗辩，根据《规定》的原则和精神，这种抗辩也不应得到法院的支持。
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