(1) 申请提出：应由犯罪地或犯罪嫌疑人、被告人居住地的市一级检察院向对应的中级法院提出没收违法所得的申请。如被告人在审理过程中死亡，原审理法院也可受理申请。
(2) 法院审查、受理：法院应在规定期限内对没收违法所得的申请进行审查，并决定是否受理。如果决定受理，应在规定期限内发布公告。公告范围应在全国公开发行的报纸或法院的官方网站上刊登，并在法院公告栏张贴和公示。如果法院已经掌握犯罪嫌疑人、被告人近亲属和其他利害关系人的联系方式，应直接告知并记录在案。
(3) 犯罪嫌疑人、被告人近亲属、其他利害关系人参加诉讼：上述人等应在公告期内申请参加诉讼，可以委托代理人。其他利害关系人是指对申请没收财产主张所有权的人。
(4) 审理：公告期满后，法院应组成合议庭进行审理。根据不同情况，法院会作出没收或驳回申请的裁定。
(5) 终止审理情形：在审理没收违法所得过程中，犯罪嫌疑人或被告人归案的，应当终止审理。
(6) 不服没收或驳回申请裁定的救济：
a、对没收财产的裁定不服的，犯罪嫌疑人、被告人近亲属或其他利害关系人可以在收到裁定书之日起五日内提起上诉；检察院对驳回申请的裁定不服的，也可以在规定期限内提出抗诉。
b、没收违法所得的裁定生效后，犯罪嫌疑人或被告人到案并提出异议的，法院应根据情况不同分别处理：原裁定正确的，予以维持；原裁定确有错误的，应撤销原裁定，并对涉案财产一并作出处理。
c、依照审判监督程序予以纠正已生效的没收违法所得裁定。
总的来说，刑诉法规定的违法所得没收程序具有重大意义，特别是在打击贪污贿赂和恐怖活动犯罪方面。
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