在自上而下审计过程中，首先要听取项目单位负责人的工作汇报。通过了解项目管理、进展情况以及资金的来源、管理和使用情况，可以初步判断项目单位资金管理使用的风险程度。
与项目单位负责人、主管施工生产人员和财务人员进行座谈，了解苗木等购调来源、方法和资金拨付办法。同时，了解整地栽植的组织、验收和资金拨付办法，以及管理费等其他支出的政策掌握。这为下一步查验账目和询问调查打下基础。
自上而下审计中，需要首先检查项目单位是否按规定单独建账，项目资金是否专户储存，账面资金收支、结余与开户行是否一致。其次，需要编制项目资产负债表和收支明细表，以掌握资金来源和运用的总体情况。最后，需要分支出项目，汇总有疑问支出内容。
通过询问项目单位负责人、主管施工生产人员和财务人员，可以责令提供账证中不完备的手续，并解决疑问支出。同时，还需掌握未解决疑问支出的去向，为下一步审计调查做准备。
自上而下审计中，需要进行苗木供应商、施工单位或个人的调查，核实苗木款、整地款、栽植款、基建款等支出的真实性和合法性。同时，对存在往来款项的账目也需要进行审计调查。
通过对听汇报、座谈、查验账目、询问和调查情况进行综合分析，结合项目验收报告，得出审计结论。综合分析的内容包括：项目单位是否严格执行上级管理制度并建立起适合本单位实际的项目管理制度，项目资金是否按计划落实到位（包括配套资金），是否单独建账并专户储存资金，是否按计划使用资金，各项支出的真实性、合法性和效益性如何，有无挪作他用资金，是否划分生产性支出和非生产性支出，项目管理中是否存在腐败问题等等。
以上六个方面的审计方法（或称环节），听汇报、座谈、询问要听得清楚、谈得全面、问得详细；查验账目要认真仔细，对于大型项目可采取抽查，但抽查面不宜低于60%；验账目是审计的最重要的环节，对于林业项目资金审计来说，审计调查是有效的手段，可采取抽查的办法，抽查比例可掌握在50%左右；综合分析是审计的结论环节，要抓住重点，过滤出存在的主要问题。
审计工作底稿的规范性要求、现状和问题以及审计工作底稿的要素和构成。审计工作底稿是注册会计师执行审计业务的必要记录，包括审计计划及实施过程、结果等重要事项。然而，当前审计工作底稿存在内容不规范、复核制度不健全、分类混乱等问题。为了提高审计工作质量，需要
政府审计中的电子取证权限及其模糊边界问题。政府审计机关的电子取证权限源于《审计法》和《审计法实施条例》，电子取证范围包括被审计单位的电子数据和系统。但在特殊情况下，如对被审计单位为其他单位代建账所形成的电子版会计资料等取证内容，以及被审计单位拒绝提供
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