依据我国相关法律的规定，对厂房进行征收拆迁时，生产设备的损耗赔偿由当事人协商确定，协商不成的，可以委托房地产价格评估机构通过评估确定。
《国有土地上房屋征收评估办法》
第十四条 被征收房屋价值评估应当考虑被征收房屋的区位、用途、建筑结构、新旧程度、建筑面积以及占地面积、土地使用权等影响被征收房屋价值的因素。
被征收房屋室内装饰装修价值，机器设备、物资等搬迁费用，以及停产停业损失等补偿，由征收当事人协商确定;协商不成的，可以委托房地产价格评估机构通过评估确定。
首先，根据当前的法律，被认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑，被征收拆迁时，不予补偿。
其次，以下几种情况即所谓的违章建筑：
1、占用已规划为公共场所、公共设施用地或公共绿化用地的建筑;
2、不按批准的设计图纸施工的建筑;
3、擅自改建、加建的建筑;
4、农村经济组织的非农建设用地或村民自用宅基地非法转让兴建的建筑，特区内城市化的居民委员会或股份合作公司的非农业用地非法转让兴建的建筑;
5、农村经济组织的非农业用地或村民自用宅基地违反城市规划或超过市政府规定标准的建筑;
6、擅自改变工业厂房、住宅和其他建筑物使用功能的建筑;
7、逾期未拆除的临时建筑;
8、其他违反法律、法规有关规定的建筑。
所以，若是符合以上情况的违章建筑，那么即可能无法拿到补偿。
不过，因为实际中的情况不一，由以下情形造成的违章建筑也可以获取补偿：
1、《城乡规划法》实施前搭建的建筑;
2、无故意抢种抢修获取补偿的建房，比如一些不懂法，不知道当前政策的人搭建的建筑;
3、因为房屋主管部门过错搭建的违章建筑，比如因审批问题建成的违章建筑。
厂房部分承租、部分自建情况下拆迁时的补偿问题。被征收人可享受房屋价值、搬迁与临时安置、停产停业损失补偿。房屋价值补偿不得低于市场类似房地产价格，具体由评估机构评估确定。拆迁评估流程包括评估机构接受任务、准备资料、现场勘查、综合分析、编写报告等步骤。
城市房屋拆迁的管理办法，旨在保障城市建设的顺利进行，保护拆迁当事人的合法权益。其中详细阐述了拆迁的原则、拆迁人的定义、拆迁的必要条件和提交的文件资料等。市城建主管部门负责房屋拆迁工作，各级人民政府和有关部门应配合保障拆迁工作顺利进行。
商铺拆迁补偿的标准，包括搬迁前期和过程中的费用补偿、基于拆迁政策的奖励费用以及拆除非住宅房屋造成停产停业的补偿。具体补偿包括机器设备调试修复等费用、速迁费及拆迁奖励等，且因拆迁导致的停产停业商铺将根据过渡期限给予相应补偿。因拆迁导致的商铺停租也将得到
国有土地上房屋征收与补偿条例中关于拆迁补偿的范围，包括房产、建筑物及土地、设备和设施的补偿，以及停产停业损失。房产和建筑物的补偿包括工业厂房、仓库、住宅和办公房等，土地补偿涉及国有和集体土地的性质，设备的补偿包括不可移动设备和可移动设备的搬迁费用等。
