依据我国相关法律的规定，快递公司将重要的文件遗失的，由快递公司进行赔偿，如果邮件是保价的，快递公司赔偿所有的损失。
《中华人民共和国邮政法》
第四十七条 邮政企业对给据邮件的损失依照下列规定赔偿:
(一)保价的给据邮件丢失或者全部损毁的，按照保价额赔偿;部分损毁或者内件短少的，按照保价额与邮件全部价值的比例对邮件的实际损失予以赔偿。
(二)未保价的给据邮件丢失、损毁或者内件短少的，按照实际损失赔偿，但最高赔偿额不超过所收取资费的三倍;挂号信件丢失、损毁的，按照所收取资费的三倍予以赔偿。
邮政企业应当在营业场所的告示中和提供给用户的给据邮件单据上，以足以引起用户注意的方式载明前款规定。
邮政企业因故意或者重大过失造成给据邮件损失，或者未履行前款规定义务的，无权援用本条第一款的规定限制赔偿责任。
货物运输是有风险的，发生货物损毁灭失的原因非常多，有些是可以避免的，有些是不可以避免的，若一律要承运人赔偿，显然是不合理。所以法律规定，在满足一定条件时，承运人是可以不承担赔偿责任的。
1、不可抗力导致的。不可抗力是指当事人不能预见、不能避免并且不能克服的客观情况，包括地震、台风、洪水等自然灾害，也包括骚乱、战争等社会现象。
2、货物的自然属性。货物本身的自然性质，主要是指货物的物理属性和化学属性，例如运输的货物是气体，而气体的自然属性就是易挥发，若由于挥发造成损失，承运人就不承担损失。
3、货物自身的合理损耗。货物的合理损耗，主要是指一些货物在长时间的运输过程中，必然会有一部分损失，对于这一部分损失，承运人也不负赔偿责任。
4、由委托人或者收货人的原因造成的。
俗话说：“口讲无凭”。托运人将货物交给承运人后，货物实际已经交由承运人保管掌控，其他人根本难以得知货物的实际情。若发生货物损毁灭失时，即使实际确实存在上述情形，承运人也必须提供充分的证据资料予以证明，否则承运人都必须赔偿。
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