1、用人单位无故克扣劳动者工资，劳动者向劳动仲裁机构申请劳动仲裁的，申请劳动仲裁程序如下：
(1)、准备劳动仲裁材料，如申请书;劳动关系成立证明;拖欠工资证据等;
(2)、确定劳动仲裁机构后，向劳动仲裁机构提交材料，申请劳动仲裁;
(3)、劳动仲裁机构对申请材料进行审查，符合仲裁条件，受理案件，确定开庭的时间。
2、法律依据：《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十八条、第二十九条
1、调解。申请劳动仲裁，需要向当地的仲裁委员会提交仲裁申请书。若双方当事人均同意调解的，会先行组织调解。经过调解达成一致意见后，仲裁委员会会做出调解书，此时程序终止。
2、撤诉。申请人在仲裁期间若不想进行劳动仲裁之后，可以自行撤诉。若开庭申请人无正当理由不到庭的，可会按照撤诉处理。撤诉之后，仲裁委都会出具仲裁决定书。
3、裁决。调解不成的，申请人在仲裁期间也没有提出撤诉时，仲裁委会在规定的时间内做出仲裁裁决书。仲裁裁决之后并非案件的终结，若申请人不服或者被申请人对裁决结果不认可时，可以自行到人民法院起诉。
劳动仲裁案件的受理期限为一年，期间会因为不同情况有所中断或中止。申请劳动仲裁时，需递交申请书和相关证据，经过仲裁委员会受理决定后组成仲裁庭。仲裁程序包括答辩、公开进行、当事人到庭义务等。仲裁庭会在查明事实基础上先行调解，若调解不成会及时作出裁决，裁决
仲裁时效一年规定不具有溯及力的问题。根据《中华人民共和国立法法》的规定，劳动仲裁法作为劳动法的特别规定，其规定的仲裁时效一年与劳动法的仲裁时效六十日不一致，应当适用劳动仲裁法的新规定。但新规定只能适用于5月1日起发生的情况，不能溯及之前。因此，当事人
工伤认定与劳动仲裁之间的关系和程序优先顺序。在解决民事纠纷的背景下，仲裁具有更高的效力，但在工伤认定中，劳动仲裁并不是前置程序。工伤认定部门对劳动关系可以进行形式审查并进行事实认定。在涉及劳动仲裁的情况下，应根据具体情况决定是否暂停工伤认定程序，并在
劳动仲裁庭人员缺席的处理方式。对于申请人缺席，若收到书面通知后无正当理由拒不到庭或中途退庭，视为撤回仲裁申请；对于被申请人缺席,可以进行缺席裁决。申请劳动仲裁不需提供证据，但提交材料要求严格，包括登记申诉表、申诉书等。
