股东转让出资后，可能会导致股东名册与公司记载不一致的情况。为保持股东名册与公司登记之间的一致性，公司应当及时办理变更登记。如果未经登记或未及时办理变更登记，则不能对抗第三人。也就是说，如果第三人通过受让出资等方式成为公司股东并记载于股东名册后，若未在公司登记机关办理相关登记，则不能主张该第三人的股东资格无效。
有人认为股权转让的生效时间应从办理工商变更登记之日起生效，依据是国家工商局在《关于股权转让有关问题的答复》(工商企字[2000]第262号)中的规定。该规定指出，股东转让股权后，受让人直接支付出让人已缴付的出资额，无需向公司重新入资，经公司变更登记后即成为公司股东。
然而，依据这一规定认定股权转让的生效时间是不妥的，理由如下：
股权转让是当事人之间依双方约定而产生的民事法律行为，是双方订立的合同。根据我国《合同法》第四十四条和最高人民法院《关于适用〈合同法〉若干问题的解释》第四条的规定，只有法律、行政法规才有权规定合同应当办理批准、登记手续后生效。目前，我国立法中尚未规定有限责任公司股东转让股权必须在办理工商变更登记手续后方可生效，因此，国家工商局的文件并非法律、行政法规。
国家工商局的《关于股权转让问题的答复》规定与新《公司法》第三十三条第二款的规定即“记载于股东名册的股东，可以依股东名册行使股东权利”相悖。根据法律文件的位阶和新旧，我们应当不予执行国家工商局的规定。
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新公司法下股权转让的条件。股东可以将其股权全部或部分转让给其他股东或外部人士。向其他股东转让股权只需双方同意，而向外部人士转让则需其他股东过半数同意，并遵循详细的手续规定。其他股东在同等条件下享有优先购买权。如有争议，按出资比例行使优先购买权。
有限责任公司股东的退出方式。股东无法通过退伙方式退出，但可通过股权转让退出。股权转让需遵守公司法的规定，包括书面通知其他股东并征求同意、优先购买权等。合伙人退伙则依据合伙企业法，包括约定退伙事由、自动退伙情况等，需遵守相关规定和程序。
公司设立的定义以及发起设立方式的特点。公司设立是依法取得法人资格的法律行为。有限责任公司的设立只能采取发起设立方式，由全体股东出资设立，程序简便且成本较低。发起设立方式最适合有限责任公司，有利于迅速成立公司，保护股东利益。
股东出资瑕疵情况下是否可以转让股权的问题。虽然股东出资不到位或抽逃出资后仍然拥有股东资格并可以转让股权，但股权存在瑕疵，转让后原股东需在出资不足的范围内承担补充性的赔偿责任。公司债务不会因为股权转让而免除。
