根据合同通用条款及价款结算办法的有关规定，工程实行预付款的合同双方应在合同专用条款中约定。预付款是施工准备和所需材料、结构件等流动资金的主要来源，国内习惯上又称为预付备料款。
根据《建设工程价款式结算暂行办法》的规定，发包人应在具备施工条件下，在双方签订合同后的1个月内或不迟于约定开工日期前的7天内预付工程款。如果发包人未按时约定预付款项，承包人应在预付时间到期后10天内向发包人发出要求预付的通知。如果发包人在收到通知后仍不按要求预付款项，承包人可在发出通知后的14天内停止施工。此时，发包人应支付应付款项的利息，并承担违约责任。
包工包料工程的预付款应按合同约定拨付。原则上，预付比例不低于合同金额的10%，不高于合同金额的30%。对于重大工程项目，预付款应按年度工程计划逐年预付。对于计价执行《建设工程清单计价规范》的工程，预付款应在合同中分别约定实体性消耗和非实体部分的预付款比例。
工程预付款的扣回起扣点的计算公式为T=P-M/NP。其中，T表示起扣点，即预付备料款开始扣回的累计完成工作量金额；M表示预付备料款数额；N表示主要材料和构件所占总价款的比重；P表示承包工程价款总额（或建安工作量价值）。
例如，某项工程合同价值为100万，预付备料款数额为24万，主要材料和构件所占比重为60%。根据起扣点计算公式，可得到起扣点为60万元。即当工程量完成60万元时，本项工程的预付款开始扣回。
如果承包合同中约定，工程质量保证金从承包人每月的工程款中按比例扣留，工程预付款的起扣点应为T=P(1-K)-M/N。其中，K表示质量保证金率。其他符号的含义与上述相同。
例如，某项工程合同价值为100万，预付备料款数额为24万，主要材料和构件所占比重为60%，质量保证金率为10%。根据起扣点计算公式，可得到起扣点为50万元。即当应付工程款为50万元（对应完成工作量金额为55.55万元）时，本项工程的预付款开始扣回。
如果质量保证金最后一个月一次扣留，起扣点的计算公式与上述相同。
预付款的法律性质及其在工程合同中的应用。预付款是暂时放在对方那里的钱，属于债权和债务。我国担保法规定，定金可作为债权的担保。施工合同中预付款的约定包括预付时间和数额，预付款的扣回方式和时间，以及担保手段来降低风险。预付款额度一般不宜超过工程量的50%
履约担保的不同形式，包括工程履约担保、预付款担保和业主支付担保等。这些担保形式旨在保障合同双方履行相应义务，涉及多种担保方式和具体操作细节，如担保的有效期、担保金额等。除此之外，还有其他基于商业合同的履约担保。
工程竣工后的结算问题。工程竣工后必须进行结算，包括按照合同约定进行的工程预付款、工程进度款和工程竣工价款的结算活动。结算方式主要有按月定期结算、分段结算和竣工后一次结算等。同时，文章还介绍了工程竣工验收的程序，包括组织验收会议、汇报工程合同履约情况等
本文介绍了一起买卖合同纠纷案例。Y公司与C公司签订的合同约定了钢材供应和付款方式。然而，C公司在供应了一部分货物后拒绝继续供货，导致Y公司工程停工一个月，损失30万元。Y公司向法院提起诉讼，要求解除合同并退还预付款，以及要求C公司赔偿损失。C公司辩称
