根据《中华人民共和国民法通则》第一百二十条和第一百三十四条的规定，人民法院可以根据以下方式对侵犯发明人名誉权的行为进行处罚：
人民法院可以判决侵权人停止侵害发明人的名誉权。
人民法院可以判决侵权人恢复发明人的名誉。
人民法院可以判决侵权人向发明人赔礼道歉。
人民法院可以判决侵权人向发明人赔偿因侵犯名誉权而造成的经济损失。
人民法院可以判决侵权人向发明人支付精神损害抚慰金。
如果侵权人拒不执行上述判决，则可以采取以下措施：
人民法院可以在相关报刊上公告侵权人的行为，并由侵权人承担公告费用。
人民法院可以对侵权人进行罚款、拘留等处罚。
人民法院可以对侵权人的财产进行强制执行。
人民法院可以判决侵权人支付延迟履行金。
根据最高人民法院《关于审理名誉权案件若干问题的解答》第7条的规定，确定行为人是否侵害他人名誉权，需要从以下四个方面进行判断：
行为人对于他人名誉权受侵害的事实主观上存在过错，包括故意和过失。
行为人的行为违反了法律和行政法规的规定。
侵犯名誉权的行为导致了损害后果，包括社会对个人品德评价的降低和商誉的下降等。
侵犯名誉权的行为必须直接导致损害后果，而非间接导致，以避免权利滥用。
需要注意的是，对于行为人是否存在过错、行为是否违法、损害后果的存在以及与违法行为的因果联系，法院会根据具体案件自由裁量，目前还没有明确的衡量尺度和规定。
名誉侵权案件中的证据要求及确定名誉侵权责任的要素。涉及侵权事实的证据包括文字、音像制品、口头及其他形式的侵权证据，侵权后果的证据需证明直接经济损失及精神损失。法人需提交资格证明和法定代表人身份证明，委托代理诉讼需授权委托书。确定名誉侵权责任考虑主观过
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