风险一：主体资格和经营范围的风险

第三方支付平台依靠银联建立，除少数几个不直接管理资金的平台外，其他平台可直接支配交易资金，这可能导致资金不受监管或越权调用的风险。这些支付服务涉及支付结算账户和提供支付结算服务，突破了一些特许经营的限制。根据商业银行法等法律法规，支付结算业务和支付清算业务实际上属于银行专有业务。然而，许多企业为了避免被认定为吸收公共存款，声称只提供代理服务。然而，在商业银行法中，这种代理服务被视为代理收付款业务，也是银行业务。非银行机构从事这种业务实际上是突破了特许经营的法律限制。

风险二：结算和虚拟账户资金利益归属风险

第三方支付平台利用资金的暂时停留，在交易过程中约束和监督了卖家和买家。然而，需要注意的是，当卖方将资金划入第三方账户时，第三方实际上扮演了资金保管人的角色。资金的所有权并没有转移，买方仍然是资金的所有人。当买方通过第三方向卖方付款时，款项的所有权仍然属于买方，直到款项进入卖方账户或买方确认接受付款后，所有权才转移到卖方。可以看出，第三方作为款项的保管人，始终不具备资金的所有权，只有保管义务。随着用户数量的增长，沉淀资金的量将会非常庞大。根据结算周期的不同，第三方支付公司可以获得定期存款或短期存款的利息，而利息的分配将成为一个重大问题。

风险三：沉淀资金流动性风险

沉淀资金的风险存在两个方面：第一，作为第三方支付机构，是否有权使用沉淀资金。由于第三方机构不具有银行的特性，因此使用沉淀资金存在风险。第二，如果第三方支付机构不动用交易带来的沉淀资金，使其坐拥资金而不使用，将使网上交易消费者的交易安全处于不稳定状态。特别是，当第三方支付机构对沉淀资金的使用不当导致用户遭受无法弥补的损失时，需要法律进行约束和赔偿。

风险四：非法转移资金，洗钱风险

第三方支付机构的出现增加了投资人和借款人在通过第三方支付进行交易时的诚信和标的质量保证。然而，如果非法资金进入第三方支付体系，很快就可以变成合法资金。由于第三方支付机构无法完全控制交易的真实性，无法知道所谓的标的是否已经完成流通，标的数量是否真实，这是目前无法管理和跟踪的。

风险五：信用卡套现风险

第三方支付也可能成为资金套现的工具，从而带来一定的金融风险。例如，有些网上交易实际上并不是真实的消费，而是制造一笔虚假交易，通过银行卡支付后，资金进入支付平台账户，然后通过账户转移到银行，再从银行取现。信用卡有限制额度，在这个额度内可以预先透支。提供这种支付工具是为了促进或满足支付和消费需求，而不是为了大量使用现金。对信用卡的取现有一套控制制度，或者通过交易成本限制其使用，但网上交易避开了这些限制。目前许多网站仍然免费，成本几乎为零。通过这种方式，套现变得更加方便。

风险六：交易风险

网络的虚拟性必然导致网络欺诈的发生。作为第三方支付平台，对支付资金进行保管，一旦交易完成后，由买卖双方中的一方发生欺诈，第三方支付机构必然承担一定的连带责任风险。此外，由于网络安全问题导致的电子支付被盗现象频繁发生，而且电子签名或数字签名在电子支付中的使用不足，第三方支付机构作为交易过程中的法律主体，也会承担一定的法律责任。