根据第88条第1款的规定，在本案中，应适用行政复议的规定。行政复议应作为首要程序，只有在对行政复议决定不服的情况下，才能提起行政诉讼。
根据行政复议法第12条和税收征收管理法第88条的规定，应以市国家税务局为复议机关。需要注意的是，国税机关属于垂直领导机关，因此复议机关只能是上一级主管部门。
根据行政复议法第28条第1款第(三)项的规定，具体行政行为在以下情形之一时，决定可以撤销、变更或者确认该具体行政行为违法，并可以责令被申请人在一定期限内重新作出具体行政行为：1. 主要事实不清、证据不足；2. 适用依据错误；3. 违反法定程序；4. 超越或滥用职权；5. 具体行政行为明显不当。
根据行政诉讼法第25条第2款的规定，经复议的案件，如果复议机关决定维持原具体行政行为，那么作出原具体行政行为的行政机关是被告；如果复议机关改变原具体行政行为，那么复议机关是被告。根据行诉解释第7条的规定，复议决定有以下情形之一时，属于行政诉讼法规定的“改变原具体行政行为”：1. 改变原具体行政行为所认定的主要事实和证据；2. 改变原具体行政行为所适用的规范依据且对定性产生影响；3. 撤销、部分撤销或者变更原具体行政行为处理结果。
根据以上规定，本案中应以复议机关为被告。
在行政复议决定改由药厂缴纳税款的情况下，于某已经不再具有原告资格，药厂可以提起行政诉讼，而于某可以作为第三人参加诉讼。
根据行政诉讼法第33条的规定，在诉讼过程中，被告不得自行向原告和证人收集证据。因此，在本案中，县国税局自行收集证据证明于某与厂方确系委托代理关系而改变所作具体行政行为的做法是非法的。
于某受某厂指派在本县范围内收购药材2万斤，厂方提供了介绍信、营业执照副本。于某收购后未向税务机关纳税。县国家税务局知悉后即作出决定，要求于某缴纳税款5000余元。于某不服，认为自己是接受本厂的指派，与该厂是委托关系，其税款应当由厂方缴纳。县国税局未采纳于某的意见，坚持要求于某纳税。
答：不能。根据适用法律规定，纳税人与税务机关在纳税问题上发生争议时，应先缴纳税款及滞纳金或提供相应担保后，才能提起行政复议。只有对行政复议决定不服的情况下，才能提起行政诉讼。
答：应以市国家税务局为复议机关。
答：复议机关可以作出以下处理：1. 确认县国税局决定违法，可以责令其重新作出决定；2. 撤销县国税局决定，可以责令其重新作出决定；3. 直接变更县国税局的决定。
答：应以复议机关为被告。
答：厂方可以作为原告提起行政诉讼，于某则作为诉讼的第三人。
答：这种做法没有法律依据。根据行政诉讼法的规定，被告在诉讼期间不得自行向原告和证人收集证据。
行政诉讼证据的法定种类，包括书证、物证、视听资料、证人证言、当事人陈述、鉴定结论以及勘验笔录和现场笔录等。这些证据在行政诉讼中都必须提供，并且人民法院会对这些证据的合法性和真实性进行审查核实，作为判决和定案的依据。摘要的结尾强调了人民法院对行政诉讼证
行政诉讼作为社会纠纷解决机制中，和解协调的重要性及其现实意义。建立行政诉讼和解制度能够确保国家利益、公共利益及他人利益得到维护，并降低成本、节约资源，通过缓解对抗，使行政主体自纠不足。在和解决行政纠纷的过程中，和解协调有助于化解矛盾，增进双方理解和信
行政复议和行政诉讼的适用条件。首先，行政复议应作为首选程序，只有在不服行政复议决定时，才能提起行政诉讼。复议机关的选择需遵循行政复议法和税收征收管理法的规定。行政复议的撤销、变更和确认具体规定了五种情形。复议决定和行政诉讼中的被告身份取决于复议机关是
行政诉讼的审判期限和相关特征。一审行政案件的审判期限为三个月，特殊情况可延长，需经高级人民法院及以上批准。行政诉讼的特征在于审理行政案件，解决行政争议，属于司法活动，并审查行政行为的合法性。其受案范围是特定的，并不解决所有类型的行政争议。
