根据我国相关法律规定，对于擅自提高经济适用住房或集资合作建房销售价格等价格违法行为，价格主管部门将依法进行处罚。
根据《经济适用住房管理办法》第二十条的规定，确定经济适用住房的价格应当以保本微利为原则。价格主管部门会同经济适用住房主管部门，根据经济适用住房价格管理的相关规定，综合考虑建设、管理成本和利润等因素，确定经济适用住房的销售基准价格及浮动幅度，并向社会公布。房地产开发企业实施的经济适用住房项目利润率不得高于3%；市、县人民政府直接组织建设的经济适用住房只能按成本价销售，不得获利。
根据《经济适用住房管理办法》第四十二条的规定，市、县人民政府及其有关部门应当加强对经济适用住房建设、交易中违纪违法行为的查处。
具体的处罚措施如下：
1. 对于擅自改变经济适用住房或集资合作建房用地性质的行为，国土资源主管部门将按照相关规定进行处罚。
2. 对于擅自提高经济适用住房或集资合作建房销售价格等价格违法行为，价格主管部门将依法进行处罚。
3. 对于未取得资格的家庭购买经济适用住房或参加集资合作建房的行为，经济适用住房主管部门将限期按原价格并考虑折旧等因素作价收购所购买或集资建设的住房；如果无法收购，则经济适用住房主管部门将责成其补缴经济适用住房或单位集资合作建房与同地段同类普通商品住房价格差，并对相关责任单位和责任人依法进行处罚。
经济适用住房基准价格由开发成本、税金和利润三部分构成。
1. 征地和拆迁安置补偿费，按照法律、法规规定用于征用土地和拆迁补偿等所支付的费用。
2. 前期工程费，包括工程勘察、规划及建筑设计、施工通水、通电、通气、通路及平整场地等勘察设计和前期工程所发生的费用。
3. 主体房屋建筑安装工程费，包括房屋主体部分的土建工程费、水暖电气安装工程费及附属工程费。
4. 住宅小区基础设施建设费，包括在小区用地规划红线以内与住房同步配套建设的基础设施建设费，以及按政府批准的小区规划要求建设的不能有偿转让的非营业性公共配套设施建设费。
5. 管理费，按照不超过开发成本项1至4目费用之和的2%计算。
6. 贷款利息，按照房地产开发经营企业为住房建设筹措资金所发生的银行贷款利息计算。
7. 行政事业性收费，按照国家有关规定计收。
根据国家规定的税目和税率计算。
按照不超过开发成本项1至4目费用之和的3%计算。
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